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[新手求助] Gaussian计算怎么把优化后的初始结构设为gjf文件进行再次优化呢?

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楼主
Gaussian计算时用精度较小的基组进行了几何优化得到了一个初始结构,然后想用得到的初始结构作为更高精度的基组的结构再次进行优化,但是是用学校服务器算的,只能用fchk和log文件看优化后的结构,我该怎么把优化后的结构设为gjf文件进行再次优化呢?

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发表于 Post on 2023-10-24 18:28:10 | 只看该作者 Only view this author
用GaussView打开log文件,将最后一帧结构另存为gjf文件
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-24 20:33:41 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-10-24 18:28
用GaussView打开log文件,将最后一帧结构另存为gjf文件

最后一帧结构就是gaussview里面显示出来的那个结构吗?还是它在哪里呀?

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发表于 Post on 2023-10-24 20:38:32 | 只看该作者 Only view this author
abu123 发表于 2023-10-24 20:33
最后一帧结构就是gaussview里面显示出来的那个结构吗?还是它在哪里呀?

GaussView面板上点击左上角File->Open,勾选Read Intermediate Geometries。重启GaussView,打开log,可以看到优化中每一帧结构。

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自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2023-10-24 21:10:31 | 只看该作者 Only view this author
反正你是最终一定脱离不了使用Multiwfn的,建议好好看看sob老师的博文http://sobereva.com/530,还有一些批量输出的博文你顺着自己找找吧

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发表于 Post on 2023-10-25 10:15:12 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn载入优化任务的out/log文件,然后输入gi,再输入要保存的gjf文件名,此时里面的结构就是优化最后一帧的。这非常省事,还避免了使用完全图形界面的GaussView
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-25 15:59:10 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-10-24 20:38
GaussView面板上点击左上角File->Open,勾选Read Intermediate Geometries。重启GaussView,打开log,可 ...

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-25 16:00:53 | 只看该作者 Only view this author
Infaltion 发表于 2023-10-24 21:10
反正你是最终一定脱离不了使用Multiwfn的,建议好好看看sob老师的博文http://sobereva.com/530,还有一些批 ...

好的,谢谢老师,Multiwfn和gaussian都在慢慢学习

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-25 16:25:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-25 10:15
Multiwfn载入优化任务的out/log文件,然后输入gi,再输入要保存的gjf文件名,此时里面的结构就是优化最后一 ...

好的,知道啦,谢谢老师

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发表于 Post on 2023-11-3 09:57:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-25 10:15
Multiwfn载入优化任务的out/log文件,然后输入gi,再输入要保存的gjf文件名,此时里面的结构就是优化最后一 ...

请问sob老师 那我直接读取上一个优化结构的chk文件 来继续优化和您说的那种方法哪种方法更好使一点呢

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发表于 Post on 2023-11-4 04:56:23 | 只看该作者 Only view this author
Lzw1281 发表于 2023-11-3 09:57
请问sob老师 那我直接读取上一个优化结构的chk文件 来继续优化和您说的那种方法哪种方法更好使一点呢

一样
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2023-11-4 18:28:43 | 只看该作者 Only view this author

好的 谢谢sob老师

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发表于 Post on 2024-3-25 20:31:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-25 10:15
Multiwfn载入优化任务的out/log文件,然后输入gi,再输入要保存的gjf文件名,此时里面的结构就是优化最后一 ...

又学到了,最近跟着老师学了很多知识,期待下次去现场跟sob老师请教

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