计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 499|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 求助二维周期性体系涉及阴离子反应计算问题

[复制链接 Copy URL]

74

帖子

0

威望

951

eV
积分
1025

Level 4 (黑子)

本帖最后由 pet 于 2023-10-30 13:18 编辑

有一个实验合作的文章,目的是证明相较于中性分子,采用带2个负电荷的分子进攻二维体系,更容易成共价键。反应体系没有金属原子。
所以我需要分别计算中性条件下二者的物理和化学吸附能,以及是否有过渡态,和阴离子条件下二者的物理和化学吸附能及过渡态。在计算时采取了两种策略,都遇到了各自的问题,也不确定哪种处理更合适。

1. 140个原子,用VASP计算,取 2 2 1  K点,看手册里说VASP计算离子体系不准,论坛里看到老师说要加抗衡离子,因为实验中用的阳离子比较大,引入两个阳离子会多106个原子,所以请问老师我用Na做抗衡离子这样处理可以嘛?

2. 切团簇补H之后166个原子,用ORCA PBEh-3c计算,物理吸附和化学吸附结构的优化大概耗时1天(24核)。然后试图找二者之间的过渡态,关键词如下,报错如图片所示,不知道这是什么原因导致的报错呢?
!PBEh-3c optTS freq nopop miniprint
%geom
Calc_Hess true
end


想请教老师们如下几个问题:
1. vasp和orca哪种处理方式更合理呢?
2. 如果用vasp,抗衡离子必须跟实验的保持一致吗?可否用Na代替?
3. 如果用orca,PBEh-3c处理该体系是否合适?过渡态报错是为啥呀? 在过渡态和频率计算时有更高效的处理方式吗?
4. 实验过程中是先用阴离子小分子进攻二位体系,但最后合成的材料肯定是中性的,理论上是否需要考虑从离子到中性的变化过程呢?



QQ截图20231030120024.png (29.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)

QQ截图20231030120024.png

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 09:41 , Processed in 0.790238 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list