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[GROMACS] 分子模拟的审稿意见回复:氢键自相关函数的收敛性判断

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本帖最后由 qiyan 于 2023-11-27 14:49 编辑

我做的体系是ILs+水,研究了内部的H键作用,借助Travis做了不同浓度下的氢键自相关函数分析,如图的形式。
审稿人提出Theconvergence of the H-bond autocorrelation functions (C(t)s) must be checked forlow water concentration systems.
没太明白啥意思。希望有大佬可以给点建议。

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202311271449256780..png

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truffle

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发表于 Post on 2023-11-27 13:55:52 | 只看该作者 Only view this author
为啥一共11条曲线却只有9个图例
No problem is insoluble in all conceivable circumstances.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-27 14:49:56 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2023-11-27 13:55
为啥一共11条曲线却只有9个图例

更新了更新了,截图搞错了,大佬有啥建议不

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Nerv

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发表于 Post on 2023-11-27 21:55:29 | 只看该作者 Only view this author
如果你的图例表示的是IL浓度的话,审稿人的意思大概是:
1.需要检查0.9和0.95浓度下水的氢键自相关函数计算是否准确。0.9和0.95的数据和其他浓度下的存在显著的差异,要确认这一结果是不是因为水分子数量太少,统计不充分导致的。
2.如果在确保统计充分的情况下结果还是如此,需要对这一结果给出合理的解释/讨论。
God's in his heaven,all is right with the world

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-28 08:47:34 | 只看该作者 Only view this author
Lacrimosa 发表于 2023-11-27 21:55
如果你的图例表示的是IL浓度的话,审稿人的意思大概是:
1.需要检查0.9和0.95浓度下水的氢键自相关函数计 ...

非常感谢您的建议。图例是水浓度,审稿人的意思是不是要延长横坐标啊,看一下水含量较低的情况,C(t)是否还有下降的趋势

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发表于 Post on 2024-10-7 21:03:29 | 只看该作者 Only view this author
请问楼主这个时间到700ps是什么意思呢?

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