建了一个甲烷干重整的模型，不确定模型的正确性，目前进行到甲烷裂解过渡态的搜索j...

MS菜鸡

参照文献建立该模型，载体MgAl2O4（切割（100）面）,晶体结构从MS材料库下载，选取的为最稳定结构（不知如何解释为什么选择此结构）。载体上方构建Ni8 团簇结构作为活性吸附物质。具体结构如下：目前进行到甲烷裂解的过渡态搜索。我自己在查找文献这一块发现用MgAl2O4作为甲烷干重整催化剂载体的较少，不能确定模型的正确性，请求指教。

MS菜鸡

@卡开发发 老师指教

卡开发发

MS菜鸡 发表于 2024-3-1 11:41
@卡开发发 老师指教

谈不上指教，涉及到的因素比较多，仅提几个个人浅薄的看法：
1、选取结构应当根据你自己研究的问题的实际情况来看，如果不能确定是何种结构，应该寻求实验表征。稳定相和稳定表面未必真是主要因素（例如催化活性）。经过表征理论上你能得到你的体系的材料结构和组分以及可能的表面，可能还需要进一步分析，例如表面暴露的位点等。
2、即便这个结构是对的，表面的厚度完全不够，可能需要合适的测试，包括真空层。
3、实际的Ni颗粒的粒径如何？Ni8团簇是否是一个合理的近似？例如XRD找出来Ni是否有晶面？
看看其他相关领域研究者是否还有更多更好的建议？

MS菜鸡

卡开发发 发表于 2024-3-1 12:42
谈不上指教，涉及到的因素比较多，仅提几个个人浅薄的看法：
1、选取结构应当根据你自己研究的问题的实 ...

谢谢老师的指教，老师提到的这几点我自己确实没有想到，只考虑了模拟方面的情况未与实际情况结合。对于老师提到的几点我还想请教请教。1，表征方面的问题我再去查找相关文献做进一步分析，暴露的位点这一点不知道如何入手。2，老师提到厚度的问题，我当初建模也想到过，考虑到原子数的问题MS的dmol3模块可能计算不动，目前原子总数已有93个 ，所以建立了此模型，对于真空层的问题未仔细研究，目前看到文献设置为15-18A.3。对于Ni团簇的构造依据，通过看到的文献分析与表征，Ni8团簇表面很相似于Ni颗粒的晶面。但是Ni颗粒的粒径这一点未考虑到，该如何入手呢。

卡开发发

MS菜鸡 发表于 2024-3-4 10:08
谢谢老师的指教，老师提到的这几点我自己确实没有想到，只考虑了模拟方面的情况未与实际情况结合。对于老 ...

1、这方面我们做计算的可能未必那么专业。你可能需要咨询做相关测试的，一般学校/院系里面可能有仪器负责的老师和同学，也许可以交流一下，或者课题组有比较熟悉的学生或者老师也可以讨论一下。
2、其实还应该确认一下你的载体到底是不是那么重要，这是一方面。另一方面是，对于服务器来说，即便是窄节点而言，我个人经验是DMol3可以算到200+的原子。当然也有更快的开源的LCAO程序，我自己使用时遇到或多或少的问题，是否愿意去折腾这些得看你自己实际情况。就DMol3而言有一些特定的好处，计算量对真空层没什么依赖，所以真空可以大胆一点取（除非存密度或静电势网格）。
3、粒径直接能够影响到模型的处理，这个问题的重要性大于第2点。

MS菜鸡

卡开发发 发表于 2024-3-4 10:53
1、这方面我们做计算的可能未必那么专业。你可能需要咨询做相关测试的，一般学校/院系里面可能有仪器负责 ...

谢谢老师的指教，您提到的问题我下去再多研究交流。关于您提到的载体的问题，我自己再思考思考。当初是为了考虑到计算量的问题所以选取原子比较少，我下去再试试。您提到的第三点我会下去仔细研究，因为如果模型有问题那就没办法继续往下做，再次感谢您的指导。我是在别的帖子下面看见您的回答，就加您的好友直接@您回答问题，有点不太礼貌，打扰您了。十分感谢您的耐心指导，我下去专研后再请您指导，再次感谢您！

卡开发发

MS菜鸡 发表于 2024-3-4 18:23
谢谢老师的指教，您提到的问题我下去再多研究交流。关于您提到的载体的问题，我自己再思考思考。当初是为 ...

说不上回答，就是讨论，很难说帖子上的说法一定对或者一定不对。

MS菜鸡

老师 您看看 今天我提到这个问题2的 outmol，

MS菜鸡

MS菜鸡 发表于 2024-3-6 17:02
老师 您看看 今天我提到这个问题2的 outmol，

@卡开发发