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[ORCA] 为什么我使用ORCA5.0.3做对称破缺计算得到的OSS单点能,它是显著大于CSS单点能呢?

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本帖最后由 13799725819 于 2024-3-19 17:53 编辑

主要想研究分子中双自由基特征,或者分子中某单原子(氮)上相互垂直的两个轨道中的单电子自旋方向问题,下面进行了三个计算:(输出文件见附件
1. 对称破缺计算(open shell singlet, OSS)输入文件:
%pal nprocs 12 end
%maxcore 2000
! RI-B2PLYP D3BJ RIJCOSX def2-TZVPD def2/J def2-TZVPD/C ExtremeSCF
%scf
HFTyp UHF
BrokenSym 1,1
end
* xyz 0 1
坐标。。。
*

------
输出文件:(附件:1.out
<S**2>(High-Spin) =   2.1019   
<S**2>(BrokenSym) =   0.3096  
E(High-Spin)      =  -505.006873 Eh(也就是“TOTAL SCF ENERGY”,下同)
E(BrokenSym)      =  -505.015144 Eh
RI-MP2 CORRELATION ENERGY:     -0.479005150 Eh
Dispersion correction           -0.003429712
FINAL SINGLE POINT ENERGY      -505.497578519065

2. 对称破缺计算,结合波函数稳定性分析(open shell singlet, OSS)输入文件:
%pal nprocs 12 end
%maxcore 2000
! RI-B2PLYP D3BJ RIJCOSX def2-TZVPD def2/J def2-TZVPD/C ExtremeSCF
%scf
HFTyp UHF
BrokenSym 1,1
STABPerform true # default false
STABRestartUHFifUnstable true # restart the UHF-SCF if unstable
STABNRoots 3 # number of eigenpairs sought
STABMaxDim 3 # Davidson expansion space = MaxDim * NRoots
STABMaxIter 100 # maximum number of Davidson iterations
STABNGuess 4096 # size of initial guess matrix: 4096 x 4096
STABDTol 0.0001 # convergence criterion from iteration to iteration
STABRTol 0.0001 # convergence criterion max residual norm
STABlambda +0.5 # mixing parameter
STABORBWIN -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1 # defines the donor / acceptor spaces
# 4 parameters for RHF
# 8 paramters for UHF (4 alpha, 4 beta)
# orbital window, -1 refers to automatic determination
STABEWIN -5.0, 5.0 # lower and upper cutoff in Eh for automatic freezing
end
* xyz 0 1
相同坐标。。。
*

------
输出文件:(附件:2.out
<S**2>(High-Spin) =   2.1019   
<S**2>(BrokenSym) =   0.3096
E(High-Spin)      =  -505.006873 Eh
E(BrokenSym)      =  -505.015144 Eh
RI-MP2 CORRELATION ENERGY:     -0.479005150 Eh  
Dispersion correction           -0.003429712
FINAL SINGLE POINT ENERGY      -505.497578519065

3. 闭壳层单重态(close shell singlet, CSS)计算输入文件:(程序默认计算RHF/RKS)
%pal nprocs 12 end
%maxcore 2000
! RI-B2PLYP D3BJ RIJCOSX def2-TZVPD def2/J def2-TZVPD/C ExtremeSCF
* xyz 0 1
相同坐标。。。
*

------
输出文件:(附件:3.out
Total Energy       :         -505.01302386 Eh(也就是“TOTAL SCF ENERGY”)
RI-MP2 CORRELATION ENERGY:     -0.492645753 Eh
Dispersion correction           -0.003429712
FINAL SINGLE POINT ENERGY      -505.509099325939

ORCA5.0.3计算的OSS能量值比CSS高了 7.23 kcal/mol。

*******************************
下面使用G09.D01进行计算:(R/U)B2PLYPD3(BJ)/def2-TZVPD
close shell singlet:
SCF Done:  E(RB2PLYPD3) =  -505.016241133     A.U. after   17 cycles
E2(B2PLYPD3) =    -0.4926741699D+00 E(B2PLYPD3) =    -0.50550891530248D+03
输出文件总结部分@:
HF=-505.0162411\MP2=-505.5089153

比ORCA5.0.3计算的结果大了:0.12 kcal/mol

open shell singlet:
SCF Done:  E(UB2PLYPD3) =  -505.018047107     A.U. after   28 cycles
<S**2>= 0.3688
E2(B2PLYPD3) =    -0.4844192704D+00 E(B2PLYPD3) =    -0.50550246637785D+03
输出文件总结部分@:
HF=-505.0180471\MP2=-505.5024664

比ORCA5.0.3计算的结果大了:-3.07 kcal/mol

G09.D01计算的OSS能量值比CSS高了 4.05 kcal/mol。


















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发表于 Post on 2024-3-12 08:12:39 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wjc404 于 2024-3-12 08:37 编辑

对称破缺计算不是黑箱,需要有一定的经验。你的体系期望对称破缺的原因是啥(过渡金属反铁磁耦合/双自由基体系/反芳香性共轭/...)?

在对称破缺的计算中,可以尝试让程序生成spin natural orbitals或unrestricted natural orbitals(翻翻orca手册看怎么生成),然后用molden或multiwfn等可视化软件,查看占据数绝对值接近1的轨道是否合适。

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发表于 Post on 2024-3-12 09:47:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2024-3-12 09:50 编辑

提供的信息不足,无法下结论。还没到看轨道、轨道占据数的时候,先自己想一下回答这些问题
(1)你用的是双杂化泛函B2PLYP,因此1个输出文件里至少有2个能量,第一个是SCF收敛处的自洽泛函的能量,第二个是真正的双杂化泛函能量。你没说你对两个任务比较的是哪个能量。
(2)没说自洽部分的波函数到底稳不稳定。
(3)没说到底差多少(不仅要有数值,还要有单位)。最好列个简单的表格,把自洽泛函的能量、自洽泛函的<S**2>和双杂化泛函能量都列出来。
这些都理清楚了,就搞清楚自己在算什么了。

即使你准确地回答了上述三点,即使你的计算全部合理,也有可能因为体系存在较强多参考特征,导致RDFT-B2PLYP的微扰部分失效,相关能异常(理论方法局限所致),此时可以低于其他任何方法的能量,不足为奇。

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自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-12 14:14:01 | 只看该作者 Only view this author
wjc404 发表于 2024-3-12 08:12
对称破缺计算不是黑箱,需要有一定的经验。你的体系期望对称破缺的原因是啥(过渡金属反铁磁耦合/双自由基 ...

打算研究双自由基体系,或者分子中某个原子的垂直轨道中单电子的自旋问题;可以看“分子中某个原子的垂直轨道中单电子的自旋”相反的情况吗?问题又做了补充,麻烦再给看一下,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-12 14:21:18 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2024-3-12 09:47
提供的信息不足,无法下结论。还没到看轨道、轨道占据数的时候,先自己想一下回答这些问题
(1)你用的是 ...

问题又做了补充,麻烦再给看一下,谢谢!
(1)我取的“FINAL SINGLE POINT ENERGY”应该是B2PLYP最终的能量值;要关注的是这个值。
(2)2.中做了波函数稳定性分析,我使用的是ORCA手册中的案例方法,这样做可行吗?结果显示是稳定的。
(3)这里计算的OSS和CSS的能量值相差了 > 5 kcal/mol,更新的问题中列出了这些值,麻烦再给瞧瞧,谢谢!
体系可能会有显著的多参考特征。

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发表于 Post on 2024-3-12 16:46:44 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wjc404 于 2024-3-15 08:26 编辑

你这个体系是三氟乙酰基氮宾,如果是单重态,显然有较强的multireference特征。你用的又是ORCA软件,强烈建议用NEVPT2来算,比KSDFT更好,在开启RI的情况下用def2-TZVP也不昂贵。至于活性空间的确定,可以借助https://gitlab.com/jxzou/mokit这个软件。

我用ORCA-5.0.3软件算了一下,在FIC-NEVPT2(4,4)/def2-QZVP水平下做几何优化(得用数值梯度),优化后的坐标如下:
  C      0.079167   -0.094701    0.002454
  N      1.180981    0.451291    0.310224
  O     -0.435414    0.996482   -0.336702
  C     -0.491641   -1.497699    0.005018
  F      0.412289   -2.336459    0.492546
  F     -1.581753   -1.541329    0.757217
  F     -0.804661   -1.860958   -1.230756

4e4o的活性空间用multiwfn绘制轨道,如下:

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-12 23:19:53 | 只看该作者 Only view this author
wjc404 发表于 2024-3-12 16:46
你这个体系是三氟乙酰基氮宾,如果是单重态,显然有较强的multireference特征。你用的又是ORCA软件,强烈建 ...

谢谢你的建议!

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