计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 558|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[ORCA] 求助:用MRCI做势能面扫描报错

[复制链接 Copy URL]

52

帖子

0

威望

483

eV
积分
535

Level 4 (黑子)

本帖最后由 Lapheal 于 2024-4-26 16:39 编辑

想要在orca中用FIC-MRCI做刚性扫描,扫描键长获得解离曲线。输入文件和报错如下,输入文件中%autoci模块是照着手册写的,请问这部分有误吗?

ORCA finished by error termination in MRCI
Calling Command: mpirun -np 4  /shared/software/chem/orca/5.0.4/orca_mrci_mpi scan.mrciinp scan
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465]:
  .... aborting the run






inp.png (21.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

inp.png

scan.err

926 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 6

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18151

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2024-3-27 04:19:26 | 只看该作者 Only view this author
stderr里面说得很清楚了,Some of your processes may have been killed by the cgroup out-of-memory handler.很可能是内存不够。
建议确认一下你是否真的有200000MB*4=800GB的物理内存,如果没有这么多,减小maxcore再试。
另外扫描的步长这么小的话,估计永远也算不完。一般每0.05埃一步就已经很精细了,如果需要把哪里扫得更精细一些(例如接近平衡键长的地方),再单跑一个任务专扫那一块。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

52

帖子

0

威望

483

eV
积分
535

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-27 07:05:06 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-3-27 04:19
stderr里面说得很清楚了,Some of your processes may have been killed by the cgroup out-of-memory hand ...

感谢老师答疑!
1)修改了步长,改为R= 5.0,1.0,80
2)机子有1024G的物理内存。尝试了50000MB*4=200GB,20000MB*4=80GB,任务都会在跑到00:07时准时停止报同样的错,得到相同的输出文件。200000MB*1=200GB,尝试了单核也是同样的报错。但是把%mrci模块删掉只算casscf就可以在200000MB*4=800GB成功运行。请问老师有什么建议吗?

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18151

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2024-3-27 17:19:57 | 只看该作者 Only view this author
Lapheal 发表于 2024-3-27 00:05
感谢老师答疑!
1)修改了步长,改为R= 5.0,1.0,80
2)机子有1024G的物理内存。尝试了50000MB*4=200GB ...

硬盘空间够吗?
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

52

帖子

0

威望

483

eV
积分
535

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-28 16:47:05 | 只看该作者 Only view this author

谢谢老师。在提交任务的脚本里设置了每核的内存后可以成功运行了

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 06:42 , Processed in 0.198313 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list