探究弱相互作用的初始构型问题

杉杉JY · 发表于 Post on 2024-4-8 22:15:40

想向各位请教一下，我想计算探究两个相同的分子，分子间的相互作用#p opt freq b3lyp/6-311g(d,p) scrf=(iefpcm,solvent=water) em=gd3bj，但是发现，我在gaussview里面构建的两个分子的初始构型不一样的话，输出的结果也完全不一样，这种情况应该怎么办呢？
还有就是我想证明这种分子分别以水为溶剂和甲酸为溶剂的条件下，弱相互作用预期应该是有差异的，但是计算结果发现优化后构型基本没有差异，是我溶剂的一些关键词设置的不正确嘛？
非常谢谢你们的不吝赐教。

LIEL · 发表于 Post on 2024-4-8 22:26:12

势能面有无数个最小点，初始位置有差异，两个分子最后的构型肯定也会有差异；我建议用sob老师的molclus做构型搜索：http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html。

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-9 11:29:26

认真把此文看了，了解什么叫构型搜索、为什么构型搜索对研究分子复合物至关重要
genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html

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[新手求助] 探究弱相互作用的初始构型问题