计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 623|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 不同方法计算双自由基能量的结果不一,问题何在?

[复制链接 Copy URL]

131

帖子

0

威望

511

eV
积分
642

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 林守龙 于 2024-4-21 16:14 编辑

在做有机体系双自由基的能量计算,采用了两种思路,出现了不同结果,存在疑惑,还望各位老师不吝赐教。
1. 先ub3lyp/def2tzvp计算对称破缺波函数,关键词guess=mix,stable=opt,查得<s**2>=1.0,完美双自由基?读取此波函数对结构进行了优化,发现结果中<s**2>略大于1.0,又读取此波函数在um062x/def2tzvp级别计算单点能,关键词guess=read,nosymm,输出文件中<s**2>=0.989,能量-499.435959 hartree. 为什么优化和计算单点时<s**2>又不严格等于1了?
不放心又去单独算了m062x/def2tzvp级别下的单点能,却发现结果也是-499.435959 hartree. 所以有点蒙,为什么结果会是一样的?
2. 取优化后的结构,直接基于um062x/def2tzvp计算能量,关键词 stable=opt, guess=mix,这时候<s**2>=1.0,能量-499.483404 hartree,明显低于上面的。所以该能量才是该双自由基的基态能量?是该取的吗

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18151

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2024-4-21 03:35:44 | 只看该作者 Only view this author
一个体系的双自由基波函数本来就未必是唯一的,只不过一般教程都只讲那些稳定波函数唯一的简单体系。举例:trimethylenemethane(一个碳上连三个CH2的结构,https://en.wikipedia.org/wiki/Trimethylenemethane)的基态是三重态,但是理论上它的第一单重态激发态有三个不同的双自由基波函数。
单重态双自由基的<s**2>不等于1主要有两个原因:(1)受五重态及更高的自旋多重度的自旋污染(导致<s**2>偏大);(2)两个单占轨道有少许重叠,导致有少许闭壳层单重态性质(导致<s**2>偏小)。因为(1)大于(2)和(2)大于(1)都有可能,所以<s**2>大于1或小于1都有可能
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

188

帖子

0

威望

486

eV
积分
674

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2024-4-21 10:19:29 | 只看该作者 Only view this author
把体系结构放上来,最好给一个优化后结构的XYZ文件或单点能输入文件。
用UDFT算对称破缺体系,不同的泛函给出的<S**2>不同是正常现象,HF交换成分高的泛函倾向于给出高的<S**2>。
不过你两次用同样级别(m062x/def2-TZVP)计算单点能的结果不同,这就需要让大家帮你看一下具体的波函数情况,所以建议你上传体系结构。

101

帖子

0

威望

1730

eV
积分
1831

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2024-4-21 11:30:33 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-4-21 03:35
一个体系的双自由基波函数本来就未必是唯一的,只不过一般教程都只讲那些稳定波函数唯一的简单体系。举例: ...

老师,可否简单的做双自由基在单重态和三重态条件下的优化,取能量最低的结构作为基态结构啊?

3806

帖子

4

威望

7996

eV
积分
11882

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

5#
发表于 Post on 2024-4-21 11:49:40 | 只看该作者 Only view this author
嘤嘤嘤 发表于 2024-4-21 11:30
老师,可否简单的做双自由基在单重态和三重态条件下的优化,取能量最低的结构作为基态结构啊?

阐述上本来就是这样的,没有其他做法。但在理解上,不同人对“简单的做双自由基在单重态和三重态条件下的优化”的理解是很不一样的,有不少人并不理解这句话,还有少数人会将单重态计算理解为闭壳层计算,并且一点也不检验波函数稳定性,所以你需要晒出你的关键词,让大家判定你是否做了合理的计算。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

3806

帖子

4

威望

7996

eV
积分
11882

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

6#
发表于 Post on 2024-4-21 11:53:22 | 只看该作者 Only view this author
目前只有一点可以回答:不同泛函、不同基组下的<S**2>本来就不一样,这就跟吃饭一样寻常,不值得讨论。

其他的不能下定论,您急需晒出输入、输出文件,怀疑做了一些不合理计算,甚至可能读取了错误的<S**2>值。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 00:51 , Processed in 0.206876 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list