求助：重复购买资料中截断能收敛性测试实例时调用MPI并行出错

dahai7719 · 发表于 Post on 2024-5-25 16:49:52

卢老师和各位大神您们好，我是购买CP2K资料自学，在重复截断能收敛性测试实例（用cutconv.sh 和 relconv.sh两个脚本测试资料文件SP\convtest\SiC_cutconv\下的cutconv.inp时），MPI无法调用，显示：
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLDwith errorcode 1.

NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
You may or may not see output from other processes, depending on
exactly when Open MPI kills them.

我用的是Rocky9.3, 最大核数32核，每个任务用8核跑，（nproc_per_calc=8 ；nproc_to_use=32 ）这个设置对做K点收敛性（脚本kpconv.sh测试K点输入文件）的时候都没有问题，但是做这个cutoff 收敛性测试就会出这样的错误，没有搜到相关的针对性的解决办法，望老师指点，谢谢！

dahai7719 · 发表于 Post on 2024-5-25 21:53:26

老师这个问题解决了，就是把原来输入文件里面的 MAX_SCF 1 改为128就可以，如果用比较小的1 或者2，3 都会出现同样的错误，按道理来说做SCF的轮数不应该对并行核数的调用产生直接影响，但是确实就是不行，想不通是什么逻辑，还望老师能够解惑，谢谢!

Graphite · 发表于 Post on 2024-5-25 23:02:50

这个纯粹是并行编程的问题，进程间负载不均衡、数据不同步等都有可能造成。SCF计算的任务分解也不止一种方式。对于小任务最简单的办法是减少核数或增加SCF圈数，拉长总计算时间，使各个进程负载均衡、通信一致。

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-26 04:33:22

我这里用的时候没有发现过此问题。看输出文件里其它信息判断。如果并行环境正常、脚本用法正确的话，原理上MAX_SCF不会产生这种影响。

dahai7719 · 发表于 Post on 2024-5-26 07:49:44

Graphite 发表于 2024-5-25 23:02
这个纯粹是并行编程的问题，进程间负载不均衡、数据不同步等都有可能造成。SCF计算的任务分解也不止一种方 ...

谢谢解惑！

dahai7719 · 发表于 Post on 2024-5-26 07:50:32

sobereva 发表于 2024-5-26 04:33
我这里用的时候没有发现过此问题。看输出文件里其它信息判断。如果并行环境正常、脚本用法正确的话，原理上 ...

谢谢老师解惑！

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