色散校正在高温高压化学反应的MD模拟中是否有必要添加

Zt2020666 · 发表于 Post on 2024-8-31 23:39:52

本帖最后由 Zt2020666 于 2024-8-31 23:54 编辑

最近使用基于BO近似的AIMD模拟一个500原子的有机体系固相分解，温度比较高，2000到3000K，压力也得好几个GPa。使用的PBE泛函。然后体系中不可避免会存在极性分子。在考虑加不加色散校正。主要是考虑色散校正，计算速度肯定会慢一些。所以不知道在这种情况下，加与不加D3BJ色散作用到底差异大不大。不是很想加，毕竟原子体系较大，本来计算就慢，而且我只关注原子的运动轨迹。此外，之前算别的体系加了之后，从反应趋势上，没看出来啥差异，但没做过系统的测试。大家讨论一下，加与不加色散校正在高温高压反应的模拟中差异会有多大？

blueyangliu · 发表于 Post on 2024-9-1 09:10:08

色散是很弱的作用，在高温高压MD中没什么影响

Zt2020666 · 发表于 Post on 2024-9-1 11:39:57

blueyangliu 发表于 2024-9-1 09:10
色散是很弱的作用，在高温高压MD中没什么影响

共轭梯度优化晶胞和原子位置，发现加了D3也没啥改善，甚至不加D3的晶格参数更接近实验值。

sobereva · 发表于 Post on 2024-9-2 07:16:49

D3校正对耗时几乎没有任何影响。D4倒是对耗时有不可忽视的影响，特别是目前的CP2K里的D4，这部分只能靠OpenMP并行

对于PBEsol这样本身优化大部分体系晶胞参数就已经很好的泛函，加色散校正非必须（甚至可能恶化结果），哪怕色散作用很显著。如果某泛函本身已经表现很好，加色散校正也不是必须的，加了有时反倒矫枉过正。另外，高压下一些原子间距离比平时研究的平衡距离可能明显更小，此时D3可能不理想，特意考虑了近距离相互作用情况的D3M校正此时在原理上更适合（但用于动力学模拟也未必就有更好结果）。

Zt2020666 · 发表于 Post on 2024-9-4 18:39:53

sobereva 发表于 2024-9-2 07:16
D3校正对耗时几乎没有任何影响。D4倒是对耗时有不可忽视的影响，特别是目前的CP2K里的D4，这部分只能靠Open ...

噢噢，了解了。但是有些审稿人总会提出这些问题，说白了有些工作不得不做去堵审稿人的嘴

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