M$导出的pdb格式文件，可以直接在multiwfn中进行RDG分析吗？

HerrG

敢问使用material studio导出的pdb格式文件，可以直接在multiwfn中进行RDG分析吗？为啥输出的散点图是一片空白

HerrG

还望诸dalao指点迷津

sobereva

HerrG 发表于 2024-9-23 14:08
还望诸dalao指点迷津

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “关于RDG” 改了，以后务必注意

sobereva

不能。pdb文件没波函数信息，撑死了用Multiwfn做promolecular近似的RDG或者IGM

不同分析需要什么文件在我的各种相关博文里都明确说了
使用IRI方法图形化考察化学体系中的化学键和弱相互作用
http://sobereva.com/598（http://bbs.keinsci.com/thread-23457-1-1.html）
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621（http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html）
通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用
http://sobereva.com/407（http://bbs.keinsci.com/thread-9472-1-1.html）
使用Multiwfn图形化研究弱相互作用
http://sobereva.com/68
一篇最全面介绍各种弱相互作用可视化分析方法的文章已发表！
http://sobereva.com/667（http://bbs.keinsci.com/thread-37629-1-1.html）

详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379（http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html）

HerrG

好的，感谢您的解答。以后我一定注意发帖规则。麻烦您了。

xsc6

除了pdb文件，MS软件得到的不是高斯型波函数，永远不能被multiwfn等软件做分析，建议使用MS多斟酌