MS的Dmol3计算过渡态出现异常结构求助

zhaoquanyou

各位大佬，我在MS搜索过渡态的时候，出现了这个结构，不明白是为什么，把输入文件和最终的结构文件粘下来，请大家帮我看看是为什么
输入文件# Task parametersCalculate                     ts_path
Max_path_points               10
Opt_energy_convergence        1.0000e-04
Opt_gradient_convergence      2.0000e-02 A
Opt_displacement_convergence  5.0000e-02 A
Opt_iterations                50
Symmetry                      off
Max_memory                    2048
File_usage                    smart
Scf_density_convergence       1.000000e-05
Scf_charge_mixing             2.000000e-02
Scf_diis                      6 pulay
Scf_iterations                500

# Electronic parameters
Spin_polarization             restricted
Charge                        0
Basis                         dnd
Pseudopotential               none
Functional                    pbe
Aux_density                   hexadecapole
Integration_grid              medium
Occupation                    thermal 0.0010
Cutoff_Global                 3.5000 angstrom

# Kpoint definition file (intervals/offset):
Kpoints                       file     1 2 1 0.0000 0.0000 0.0000
MFO__1_1_0__H2O2-MFO__1_1_0__H2O2.kpoints

# Calculated properties

卡开发发

也许你应该打包上传下看看，我不清楚你实际截图的结构到底是什么过程产生的。

zhaoquanyou

卡开发发 发表于 2024-9-28 21:54
也许你应该打包上传下看看，我不清楚你实际截图的结构到底是什么过程产生的。

好的好的，我把文件打包一下，然后上传到附件中

zhaoquanyou

这是计算文件的内容，谢谢各位大佬能指出问题

卡开发发

zhaoquanyou 发表于 2024-9-29 11:11
这是计算文件的内容，谢谢各位大佬能指出问题

有个隐藏文件arc和outmol带上来看看。

zhaoquanyou

卡开发发 发表于 2024-9-29 18:38
有个隐藏文件arc和outmol带上来看看。

outmol这个文件太大了，上传不上来，愁死了arc的文件也找不到，人生啊

卡开发发

zhaoquanyou 发表于 2024-10-8 17:38
outmol这个文件太大了，上传不上来，愁死了arc的文件也找不到，人生啊

arc文件是隐藏文件，所以你需要调整下文件夹相关设置。