过渡态idpp插点，vtst粗收敛后，结构很奇怪

icbc · 发表于 Post on 2024-9-29 21:04:33

本帖最后由 icbc 于 2024-9-30 09:46 编辑

[attach]98901[/atta

粗收敛相关文件.rar (8.29 MB, 下载次数 Times of downloads: 3) ch]
本人最近在做，金属团簇上CO2加H,生成COOH，用idpp.py插点，vtst过渡态力0.1、能量10的-5次方标准粗收敛了，（目标H原子移动到O上，形成COOH结构）
粗收敛结束，得到的能量最高的过渡态结构，这个H原子的位置很奇怪，请@开发卡卡卡卡老师@sobereva 社长老师以及各位社友
帮我看看这个结构？或者如何调整参数可以得到更合理的结构？

卡开发发 · 发表于 Post on 2024-9-30 01:10:50

本帖最后由卡开发发于 2024-9-30 01:11 编辑

暂时判断不了，要不然把你的结构和输出文件上传看看？（包括chain上对应那几个结构的迭代输出都发来看看）。

icbc · 发表于 Post on 2024-9-30 09:48:28

卡开发发发表于 2024-9-30 01:10
暂时判断不了，要不然把你的结构和输出文件上传看看？（包括chain上对应那几个结构的迭代输出都发来看看） ...

卡卡老师，结构和输出文件我上传到附件里了，请卡卡老师help

卡开发发 · 发表于 Post on 2024-9-30 12:32:33

本帖最后由卡开发发于 2024-9-30 12:34 编辑

icbc 发表于 2024-9-30 09:48
卡卡老师，结构和输出文件我上传到附件里了，请卡卡老师help

NEB chain上面的image有些在第一步的时候SCF没收敛，还有就是你的路径可能选的也不是很好。
一个是SCF迭代相关的参数可能需要改改，还有idpp插点过后你可以再检查一下这个路径是否符合你的化学直觉或者是研究需求。
其他如磁性设置的合理性或是POTCAR的顺序方面你可能得自己检查下，我这边看起来会有点费劲。

icbc · 发表于 Post on 2024-9-30 16:05:53

好。谢谢卡卡老师。我来调整一下

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[VASP] 过渡态idpp插点，vtst粗收敛后，结构很奇怪