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[新手求助] 跑IRC后,做优化反应物,但gaussian不显示成键

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各位老师好,gaussian在优化完过渡态跑IRC后,取IRC两侧末端的初始结构做优化反应物和产物(基组# opt freq b3lyp/6-311g(d,p) em=gd3)导出log文件,优化后的产物没问题,但优化后的反应物中的光气分子COCl2中的C-Cl键没有连在一起,分别为1.95214和1.93259,单独优化光气分子的C-Cl键键长均为1.76,同样导出的fch文件键长距离不变却显示成键并且还多把C-N键连在了一起,我重新调整初始过渡态结构,重跑irc好几次,但都是出现这种现象,请教各位老师:这样的不连键的构型和计算的能量是合理的吗?如果不合理我该怎么做调整

202601221134452090..png (8.3 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

fch文件

fch文件

202601221133162462..png (14.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)

优化后的log文件

优化后的log文件

1.zip

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发表于 Post on yesterday 12:33 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 乐平 于 2026-1-22 12:34 编辑

老生常谈的话题了……

任何图形显示软件(GaussView, VMD, Jmol, Material Studio 等)看到的都不是化学键,只是显示的连接方式而已。说得更极端一些,根本就没有“化学键”这种物质!“化学键”不是可测量的物理量。

图形显示软件(GaussView 等等)也是类似地原理,如果某两个原子在某个范围内,就显示它们成键,否则就不显示连线,仅此而已。所以,只是显示而已,并不是真正的化学键。

所以,不要看连线,也不要在意那些短线。更应该关注原子间的距离。

最最本质上是原子间的距离。任何图形显示软件都是通过原子间的距离来“判断是否连接,显示'化学键' 而已”。

类似的问题我已经回答过很多次了……
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 33&fromuid=1532
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 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 13:51 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2026-1-22 12:33
老生常谈的话题了……

任何图形显示软件(GaussView, VMD, Jmol, Material Studio 等)看到的都不是化学 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 20 hour ago | 只看该作者 Only view this author
认真看经典文章:
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html
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