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[综合交流] 求助:阴离子聚合物溶液模拟的力场、电荷及水模型的选择

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楼主
本来想使用论坛sob老师推荐对聚合物的OPLS-AA+1.2*CM5的组合,但尝试后发现因为我的聚合物长链带3个负电荷,电荷乘上1.2后电荷变成了-3.6;后继续在论坛上找到sob老师说这种需要用RESP电荷,所以我想对我模拟的阴离子聚合物溶液:阴离子聚合物和金属离子使用OPLS-AA力场,阴离子聚合物电荷使用RESP电荷,水模型采用TIP4P-ICE(需负温环境模拟)。因为没有找到使用完全相同文献,所以想来求助一下大家这种OPLS-AA + RESP + TIP4P-ICE的模拟组合是否可行,若发表论文是否会被审稿老师认可。感谢。

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发表于 Post on 2026-3-19 13:34:54 | 只看该作者 Only view this author
这里引用sob老师的原话。
我的理解是1.2是一种经验的修正,CM5电荷本身与OPLS的相性会好很多,我处理类似情况的时候是直接采用CM5电荷,也就是不进行缩放。

前述J. Phys. Chem. B.文章中只是考虑了中性体系,没有考虑带电体系。带电体系用什么原子电荷结合OPLS-AA没有统一说法,一般情况下不能用1.2*CM5电荷,因为此时总电荷都不是整数了。笔者建议此时用Multiwfn算RESP2电荷,虽然与OPLS-AA兼容性没有充分测试,但原理上问题不大。
1.2*CM5电荷就是在Truhlar等人提出的原始的CM5电荷基础上乘上1.2,这相当于增大了原子电荷的数量级,等效地体现出了溶剂环境对溶质的极化作用。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-3-19 14:57:26 | 只看该作者 Only view this author
Loading0760 发表于 2026-3-19 13:34
这里引用sob老师的原话。
我的理解是1.2是一种经验的修正,CM5电荷本身与OPLS的相性会好很多,我处理类似 ...

感谢您的解答,我曾经有尝试过查找带电聚合物是否有用CM5电荷的文章,但是并没有找到较有说服力期刊的文献对这个观点进行依托,如果已发SCI文章作为模拟目标,CM5电荷是否能被审稿人承认呢?

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发表于 Post on 2026-3-19 16:33:41 | 只看该作者 Only view this author
sob老师推荐对聚合物的OPLS-AA+1.2*CM5的组合

这个说法不完整。我绝对没有将这作为唯一推荐,本身我也挺不喜欢OPLS-AA力场。我很推荐用GAFF或GAFF2结合RESP/RESP2电荷算这种体系,无论是中性还是离子情况都一样处理
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-3-19 17:31:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-3-19 16:33
这个说法不完整。我绝对没有将这作为唯一推荐,本身我也挺不喜欢OPLS-AA力场。我很推荐用GAFF或GAFF2结合 ...

非常感谢sob老师的指导,根据您的推荐并查阅相关资料,决定使用GAFF2+RESP+TIP4P-ICE的结合方式。
原因:1、GAFF2 相比 GAFF对于长链聚合物的模拟更真实平滑,会在零下环境中更自然的扭转。
2、RESP2 电荷强制要求在量子化学计算时加入隐式溶剂模型,会和我之后在体系加入TIP4P-ICE产生“双重极化”问题,聚合物不真实的亲水,导致模拟产生致命错误。而RESP电荷在真空中计算,会和TIP4P-ICE更好的结合。
再次感谢sob老师。

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