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[Gaussian/gview] 求助:利用Gaussian给锂离子溶剂化结构做结构优化分子会偏移的现象

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各位老师好,是这样的本来想着利用Gaussian计算锂离子溶剂化结构的去溶剂化能,计算的溶剂化结构是Li-EC-EB-2DEC-EMC(开始的结果如图1所示),我利用B3lyp/6-31g**做结构优化后发现EC会被挤出原来的位置(如图2所示),请问下这种情况应该怎么避免啊,所用的输入文件上传在附件,谢谢老师

202604292253035958..png (100.57 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

图2结构优化后

图2结构优化后

202604292252192857..png (99.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

图1结构优化前

图1结构优化前

Li-EC-EB-2DEC-EMC.gjf

4.48 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 12 hour ago | 只看该作者 Only view this author
一方面说明Li周围没有空间容纳这个分子了,另一方面我认为你需要做构象搜索来确定溶剂化结构

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 楼主 Author| 发表于 Post on 7 hour ago | 只看该作者 Only view this author
KazusaT 发表于 2026-4-30 00:46
一方面说明Li周围没有空间容纳这个分子了,另一方面我认为你需要做构象搜索来确定溶剂化结构

溶剂化结构不都是用MD确定嘛

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发表于 Post on 1 hour ago | 只看该作者 Only view this author
B3LYP不带色散校正优化这个完全不妥,认真看下文
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413

PS:别实际带了色散校正但没说,如果是这种情况,注意看下文“理论方法必须描述得很准确”部分
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html

如果你确信Li能和那么多分子配位,预优化时把Li和配位原子之间键长冻住,之后再放开冻结进一步优化
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on halfhour ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-4-30 11:48
B3LYP不带色散校正优化这个完全不妥,认真看下文
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适 ...

收到,谢谢老师

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