各位大神：
现有16.5万预算，要通过学校招标方式购置设备用于分子动力学模拟、分子对接和以后可能会用到的基因组数据分析（目前主要考虑前两个功能）。另外，买个便携笔记本。
实验室目前已经有一台戴尔工作站，配置如下（当时花了5.5万左右，请各位大神看看是否合理 ）：
DELL T7910 工作站 CPU:E5-4669 V4(22核心44线程) 2个 内存：128G 硬盘：240G SSD + 8T SATA 显卡: GTX1080TI显卡
本人主要用Gromacs跑分子动力学模拟，体系20万~30万原子，配置这些硬件的主要目的是在本地建立小的集群，即使不能用超算中心的资源，也可以高效地开展工作。
因为Gromacs在GPU加速上做得不错，考虑配置多核CPU+GPU提升速度。
目前想把约15.5万用于买服务器（学校网络中心可托管），1万用于买笔记本。以后有资金的话，再不断扩充服务器集群。想法和疑惑如下：
一.购买服务器2台，并行使用，最好加GPU。
问题：一个infiniband交换机就要好几万，这点预算显然性价比不高。那么两台服务器可以先用千兆交换机连接使用吗，是否影响并行效果？
GPU是使用科学计算系列如P100，还是使用Geforce等游戏显卡？P100的话，预算明显不够。游戏显卡对Gromacs运算准确性影响到底有多大？
联想给出的无GPU配置如下：
功能代码描述 数量 Mellanox ConnectX-4 Lx 1x40GbE QSFP+ 适配器 1 ThinkSystem RAID 530-8i PCIe 12Gb 适配器 1 300GB 10K 12Gbps SAS 2.5" G4HS 2 16GB TruDDR4 2666 MHz (1Rx4 1. 8 550W(230V/115V) Platinum HS PS 1 Mellanox QSFP to SFP+ 1 SFP+ SR Transceiver 1 ThinkSystem Toolless Slide Rai 1 Lenovo ThinkSystem 主流 MB - 2U 1 Xeon 4116 12C/85W/2.1GHz 2
二.集中资源配一台好一点的服务器，如Intel Xeon Gold 6132 14C 140W，256G内存，加GPU。听说Gold系列使Gromacs运算速度提升非常多。
问题：这样一台机器运行gromacs作业能达到两台服务器并行的效果吗？只是以后买机器就不好并行使用了。
三.便携笔记本目前想买Thinkpad X1 carbon，只是出差使用。
如果出差偶尔作图处理数据（如PS，matlab等），不知X1C是否能够承受？
另外，X1C的可扩展性和插口少，影响大吗。请各位有经验的小伙伴支招。
还是 T470系列更值得购入？
真的是很想买个轻的本本，但又要兼顾一丢丢的性能，毕竟大多数时间都在办公室工作。
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发表于 Post on 2017-11-2 19:18:29
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楼主 Author
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发表于 Post on 2017-11-3 16:56:26