计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 12634|回复 Reply: 13
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] Gaussian计算出现Allocation failure for numerical quadrature问题

[复制链接 Copy URL]

11

帖子

0

威望

113

eV
积分
124

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
我的输入文件:
%chk=ZnPcPDI4_model.chk
%mem=32GB
%nprocs=24
# opt b3lyp/genecp integral=(finegrid,acc2e=10)

ZnPcPDI4_model

0 1
出现如下错误:
ECPInt:  NShTT= 1023165 NPrTT= 6494122 LenC2=  188380 LenP2D=  525616.
LDataN:  DoStor=T MaxTD1= 6 Len=  172
Calling FoFJK, ICntrl=      2127 FMM=T ISym2X=0 I1Cent= 0 IOpClX= 0 NMat=1 NMatS=1 NMatT=0.
In Quad4, NSgAt2=     417 but IDerNu=1 NAtomA=     465 NAtAll=     401.
Allocation failure for numerical quadrature.
Error termination via Lnk1e in /share/home/majing/g16/l703.exe at Fri Jan 26 04:58:36 2018.
Job cpu time:       8 days 17 hours 36 minutes 27.1 seconds.
Elapsed time:       0 days 12 hours 41 minutes 40.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   9360 Int=      0 D2E=      0 Chk=   1184 Scr=     32

请求各位大神,帮助解惑。


ZnPcPDI4_model_1.gjf

27.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 13

2479

帖子

11

威望

6864

eV
积分
9563

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2018-1-29 11:40:14 | 只看该作者 Only view this author
泛函用MN15L比较好。【计算过渡金属配合物:M06、BP86、B3LYP、MN15L(哪个更好不一定,BP86有时很不错)】如果用G16,MN15L测试的结果比较好。

积分格点用int=finegrid。你的积分格点有点低。

PS:你是南*大学的吧?



11

帖子

0

威望

113

eV
积分
124

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-29 12:04:18 | 只看该作者 Only view this author
我本是个娃娃 发表于 2018-1-29 11:40
泛函用MN15L比较好。【计算过渡金属配合物:M06、BP86、B3LYP、MN15L(哪个更好不一定,BP86有时很不错)】 ...

你好,确实是**大学。不好意思,我输入文件粘贴的时候错了, 是integral=(finegrid,acc2e=10),还是出现这种错误,请问这种错误出现,是什么原因呢?

2479

帖子

11

威望

6864

eV
积分
9563

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2018-1-29 12:09:35 | 只看该作者 Only view this author
gym 发表于 2018-1-29 12:04
你好,确实是**大学。不好意思,我输入文件粘贴的时候错了, 是integral=(finegrid,acc2e=10),还是出现 ...

用MN15L泛函试试

尝试用G16的默认格点设置。

11

帖子

0

威望

113

eV
积分
124

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-29 12:14:34 | 只看该作者 Only view this author
我本是个娃娃 发表于 2018-1-29 12:09
用MN15L泛函试试

尝试用G16的默认格点设置。

您好,请问您知道怎么降低g16的收敛标准吗?

3806

帖子

4

威望

7996

eV
积分
11882

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

6#
发表于 Post on 2018-1-29 12:37:55 | 只看该作者 Only view this author
SCF收敛标准:scf(conver=N),默认是8,不建议低于7.
opt结构收敛标准:opt=xxx。其中opt=loose选项比较粗糙,适用于预优化,成功后再去掉loose优化至更严格的收敛标准。可以参看http://gaussian.com/opt/的说明。
g16的SCF收敛标准在conver=7以下时,它是不允许做opt的,会警告用户收敛限太低;实际上这也比较合理,conver小于等于6时,算单点勉强可以,做opt是过于粗糙的。
另外积分格点coarsegrid也过于粗糙,作为预优化是可以的,不适合做正式计算。
这错误比较少见,可以尝试换个泛函;如果实在想用这个泛函,可以先在其他泛函下优化好了,再改用这个泛函优化。
另外,如果是优化了几步之后出现这个问题,可以试试在一开始加上opt=calcfc;如果是第一个结构就出现这种问题,calcfc就可能没啥用了。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

3098

帖子

28

威望

1万

eV
积分
16892

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2018-1-29 13:23:52 | 只看该作者 Only view this author
检查一下计算的时候有没有那么多内存,例如你声明允许高斯用40G内存,但系统实际只剩30G这种情况

11

帖子

0

威望

113

eV
积分
124

Level 2 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-29 14:23:19 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2018-1-29 12:37
SCF收敛标准:scf(conver=N),默认是8,不建议低于7.
opt结构收敛标准:opt=xxx。其中opt=loose选项比较粗糙 ...

您好,您说的g16的scf在conver=7以下,无法做opt,是在guassian16手册的哪里,能否发一下链接,谢谢

3806

帖子

4

威望

7996

eV
积分
11882

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

9#
发表于 Post on 2018-1-29 15:02:39 | 只看该作者 Only view this author
gym 发表于 2018-1-29 14:23
您好,您说的g16的scf在conver=7以下,无法做opt,是在guassian16手册的哪里,能否发一下链接,谢谢

不需要看手册,直接运行一个甲烷的结构优化,设置scf(conver=6),报错之后打开log文件最后一百行就看到了
自动做多参考态计算的程序MOKIT

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112374

管理员

公社社长

10#
发表于 Post on 2018-1-29 15:10:49 | 只看该作者 Only view this author
典型的乱用关键词(coarsegrid)自找麻烦
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

11

帖子

0

威望

113

eV
积分
124

Level 2 能力者

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-29 15:24:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-29 15:10
典型的乱用关键词(coarsegrid)自找麻烦

sob老师,我是用了finegrid,而coarsegrid是我问问题是打错了,那原因是什么,恳请老师解答?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112374

管理员

公社社长

12#
发表于 Post on 2018-1-29 16:03:35 | 只看该作者 Only view this author
gym 发表于 2018-1-29 15:24
sob老师,我是用了finegrid,而coarsegrid是我问问题是打错了,那原因是什么,恳请老师解答?

上传输入输出文件,否则不好说
如果确认输入文件肯定没问题,尝试G09也跑一下,没准是G16 bug
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

11

帖子

0

威望

113

eV
积分
124

Level 2 能力者

13#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-29 16:27:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-29 16:03
上传输入输出文件,否则不好说
如果确认输入文件肯定没问题,尝试G09也跑一下,没准是G16 bug

sob老师,我已经上传了文件,在g09上运行也会出现这样的情况。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112374

管理员

公社社长

14#
发表于 Post on 2018-1-29 16:45:10 | 只看该作者 Only view this author
gym 发表于 2018-1-29 16:27
sob老师,我已经上传了文件,在g09上运行也会出现这样的情况。


用ultrafine再试,还不行尝试换个基组再试,还不行给官方客服发邮件反馈bug
如置顶新人必读贴所示,上传较大文本文件前一定要压缩。输出文件已删除
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 23:21 , Processed in 0.183669 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list