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[Gaussian/gview] 180多个原子体系的弱相互作用计算问题

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发表于 2018-5-19 21:27:13 | 显示全部楼层 |阅读模式
计算两个大的有机分子在水中的弱相互作用,两个分子总共180多个原子,打算先用molclus+MOPAC或者XTB搜索能量低的构象,后再用molclus+Gaussian去再优化能量比较低的前一步得到的构象,但是对于这样的大体系,请问优化的最低用的方法和基组?M062X  6-31+G* 应该是优化不动额 , 可不可以优化的时候不加弥散?或者直接用半经验优化完的,直接去算加弥散的单点?

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发表于 2018-5-19 21:29:39 | 显示全部楼层
M062X/6-31G*即可
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发表于 2018-5-19 22:21:11 | 显示全部楼层
Gaussian里用B3LYP-D3(BJ)/6-311G*优化。提升到3-zeta比用弥散便宜,用B3LYP-D3(BJ)也比M06-2X明显更便宜,还相对不容易出现虚频

半经验优化也可以接受
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发表于 2018-5-19 23:02:02 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2018-5-19 22:21
Gaussian里用B3LYP-D3(BJ)/6-311G*优化。提升到3-zeta比用弥散便宜,用B3LYP-D3(BJ)也比M06-2X明显更便宜, ...

180个原子,是不是有点儿吃力?
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发表于 2018-5-19 23:13:50 | 显示全部楼层
我本是个娃娃 发表于 2018-5-19 23:02
180个原子,是不是有点儿吃力?

看机器配置和你怎么定义吃力了。哈哈。两天算吃力吗?

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发表于 2018-5-19 23:25:48 | 显示全部楼层
为什么要用高斯呢,用orca/nwchem不好么。。。

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发表于 2018-5-20 01:30:18 | 显示全部楼层
我本是个娃娃 发表于 2018-5-19 23:02
180个原子,是不是有点儿吃力?

这个级别下400多个原子的共轭高聚物片段的激发态优化我都跑过,能跑动。
建议在自己的机器上跑,提交服务器很可能排不上队。

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 楼主| 发表于 2018-5-20 10:36:52 | 显示全部楼层
谢谢各位老师
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