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[综合交流] 过渡态、IRC做出来的反应物和产物都关于同一个Cs平面对称

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Sob老师,我做了一个反应,将两个分子(AO和BCl)放在一块生成稳定的中间体M(BOACl),然后寻找过渡态,进而做IRC分析,发现虚频震动和优化后两个产物也是关于同一个Cs平面对称(其中一个产物是中间体M),我做这个反应的初衷是想生成两个新的分子(ACl和BO),不知道我的问题表达清楚没有,望老师有空解答一下。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-21 20:18:59 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zc000 于 2018-5-21 20:20 编辑

可能我的表达有一些问题,我在做计算的时候,过渡态IRC对应的两个产物是两个“手性”分子,两个分子关于过渡态对称面对称,下图是IRC图

B$W{NTM_T5]]M3$JCS40WVX.png (37.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 30)

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发表于 Post on 2018-5-23 13:25:56 | 只看该作者 Only view this author
描述太抽象。光看你的IRC图,当前找的过渡态貌似对应两个手性异构体之间的异构化,没找到真正对应化学反应的过渡态,还得尝试其它过渡态初猜
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-26 15:13:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-5-23 13:25
描述太抽象。光看你的IRC图,当前找的过渡态貌似对应两个手性异构体之间的异构化,没找到真正对应化学反应 ...

IRC走出来两边对称。下图分别是过渡态和反应物、产物的图片。过渡态有个对称平面、虚频震动关于同一个对称平面对称、连接虚频震动的反应物、产物分子关于同一个对称平面对称

DGUOIY@$GKFI1J~]$~M44TI.png (10.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

过渡态

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发表于 Post on 2018-5-26 17:08:50 | 只看该作者 Only view this author
你这个不是反应的过渡态,只不过是一个结合体的构型转变的过渡态,而且前后结构互为手性,因此IRC肯定是对称的
如果要找对应化学反应的过渡态得重新提供其它过渡态初猜结构
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-26 21:48:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-5-26 17:08
你这个不是反应的过渡态,只不过是一个结合体的构型转变的过渡态,而且前后结构互为手性,因此IRC肯定是对 ...

明白了,虽然这个结构有一个虚频,却不是一个正确的过渡态。是这个意思吧,老师!

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发表于 Post on 2018-5-27 00:10:44 | 只看该作者 Only view this author
zc000 发表于 2018-5-26 21:48
明白了,虽然这个结构有一个虚频,却不是一个正确的过渡态。是这个意思吧,老师!

不是不正确,这是一个常规意义的过渡态,但不是对应于你要研究的化学反应的过渡态
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-27 08:42:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-5-27 00:10
不是不正确,这是一个常规意义的过渡态,但不是对应于你要研究的化学反应的过渡态

明白了,老师,谢谢您!

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