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楼主 Author: sobereva

[ORCA] 将Gaussian与ORCA联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析

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发表于 Post on 2019-11-15 11:12:24 | 显示全部楼层 Show all
moonlight2690 发表于 2019-11-11 19:07
您好,请问您上述问题如何解决的,我也遇到和你一模一样的问题,望指点一二,多谢

不用了,继续用高斯

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发表于 Post on 2019-11-15 17:12:03 | 显示全部楼层 Show all
gauss98 发表于 2019-11-15 11:12
不用了,继续用高斯

我问题解决了,如果你后续还需要的话咱们可以讨论哈~

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发表于 Post on 2019-11-26 10:31:35 | 显示全部楼层 Show all
moonlight2690 发表于 2019-11-15 17:12
我问题解决了,如果你后续还需要的话咱们可以讨论哈~

你好,我也是卡在了L402报错了,一直解决不了,请问你是怎么解决的呢?谢谢

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发表于 Post on 2019-12-18 17:07:24 | 显示全部楼层 Show all
moonlight2690 发表于 2019-11-15 17:12
我问题解决了,如果你后续还需要的话咱们可以讨论哈~

你好,请问最后是怎么解决的?我还是报这样的错误.请您指导一下,谢谢
留给自己点琢磨的时间。

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发表于 Post on 2020-2-16 14:16:16 | 显示全部楼层 Show all
本帖最后由 函数与激情 于 2020-2-16 14:17 编辑

sob老师您好,我将您文中的脚本稍作修改,试图使用openmolcas的CASPT2梯度用高斯的optimizer优化,修改后似乎是可以优化,但是并未在gaussina.log中更新优化圈数,直到最后收敛到四个YES后gaussian.log中也就只有这最后一圈的信息,log中只优化初猜结构和优化收敛的结构。不知道上述是在哪里出了问题,希望sob老师指点一下,不胜感激!

gau-openmolcas.zip

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发表于 Post on 2020-3-17 18:51:44 | 显示全部楼层 Show all
moonlight2690 发表于 2019-11-15 17:12
我问题解决了,如果你后续还需要的话咱们可以讨论哈~

我也是这个问题,如何解决的?

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发表于 Post on 2020-9-8 21:31:09 | 显示全部楼层 Show all
请问,如果将opt和freq同时设定在orca.sh里,是不是不合理的?会不会每一步结构优化都算一遍freq?

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发表于 Post on 2020-9-8 22:37:10 | 显示全部楼层 Show all
chenw 发表于 2020-9-8 21:31
请问,如果将opt和freq同时设定在orca.sh里,是不是不合理的?会不会每一步结构优化都算一遍freq?

1.opt和freq应该设在Gaussian的输入文件而不是orca.sh里,orca只负责提供能量和能量一阶二阶导数,优化算法等是Gaussian做的。
2. 应该不会,因为Gaussian每步external传递给外部的输入文件第一行都有个参数,指出这步任务要求做几阶导数。而orca.sh脚本里面也写了,只有什么情况才调用orca做一阶/二阶导数计算并回传信息。不需要的时候自然不会去算。

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发表于 Post on 2020-9-8 23:25:48 | 显示全部楼层 Show all
snljty 发表于 2020-9-8 22:37
1.opt和freq应该设在Gaussian的输入文件而不是orca.sh里,orca只负责提供能量和能量一阶二阶导数,优化算 ...

非常感谢,是我看错了;
此外我还有问题想请教一下,社长的orca.sh脚本 计算级别中没写RIJCOSX,我自己加上了,合理吗?
此外我还使用了溶剂模型,写的是CPCM(Toluene)
总的内容是:level="B3LYP D3 def2-svp def2/J RIJCOSX CPCM(Toluene)"  。怎么检验溶剂模型已被正确使用?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-9 06:34:51 | 显示全部楼层 Show all
chenw 发表于 2020-9-8 23:25
非常感谢,是我看错了;
此外我还有问题想请教一下,社长的orca.sh脚本 计算级别中没写RIJCOSX,我自己 ...

想加就加

这些本来就是直接传递给ORCA的关键词,必然会被使用。不放心的话检查一下中间产生的ORCA输出文件便知
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发表于 Post on 2020-9-9 09:05:53 | 显示全部楼层 Show all
函数与激情 发表于 2020-2-16 14:16
sob老师您好,我将您文中的脚本稍作修改,试图使用openmolcas的CASPT2梯度用高斯的optimizer优化,修改后似 ...

所以你后来问题解决了嘛

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发表于 Post on 2020-9-9 14:51:02 | 显示全部楼层 Show all
喵星大佬 发表于 2020-9-9 09:05
所以你后来问题解决了嘛

后来我写信咨询了高斯官方,问题得到了解决。
这里的问题是因为External开发时其主要目的是ONIOM计算的low layer,其假设是所调用的计算非常迅速以至于其耗时几乎可以忽略。在这种情况下,如果像通常优化一样每步都要经过几个链接(Link),打印梯度、位移等收敛限信息,调用Link本身的时间虽然很低,但如果External调用的计算几乎不花时间,相对来说Link之间的传递会明显减慢计算速度。因此,使用External优化时默认采用类似分子力场计算的MicroIteration,全部在Link 402中完成,所以不会打印中间信息。External调用CASPT2的梯度计算,花费时间远远超出在几个链接之间跳转的时间,因此可以在优化中关闭 MicroIteration,关键词是“Opt=NoMicro”,这样每步优化都会经过几个Link并打印您要的信息。

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发表于 Post on 2020-9-9 16:37:36 | 显示全部楼层 Show all
函数与激情 发表于 2020-9-9 14:51
后来我写信咨询了高斯官方,问题得到了解决。
这里的问题是因为External开发时其主要目的是ONIOM计算的l ...

我记得sob老师这个帖子里和联用xtb的帖子里都是说优化要加opt=nomicro的
也就是你那个脚本可以正常用高斯调用OpenMolca的高级别方法咯

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发表于 Post on 2020-9-9 21:21:51 | 显示全部楼层 Show all
喵星大佬 发表于 2020-9-9 16:37
我记得sob老师这个帖子里和联用xtb的帖子里都是说优化要加opt=nomicro的
也就是你那个脚本可以正常用高 ...

对的

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发表于 Post on 2021-1-16 22:01:41 | 显示全部楼层 Show all
吴国卿 发表于 2019-11-26 10:31
你好,我也是卡在了L402报错了,一直解决不了,请问你是怎么解决的呢?谢谢

应该是你的orca目录写错了,再仔细检查一下~

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