将Gaussian与ORCA联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析

gauss98 · 发表于 Post on 2019-11-15 11:12:24

moonlight2690 发表于 2019-11-11 19:07
您好，请问您上述问题如何解决的，我也遇到和你一模一样的问题，望指点一二，多谢

不用了，继续用高斯

moonlight2690 · 发表于 Post on 2019-11-15 17:12:03

gauss98 发表于 2019-11-15 11:12
不用了，继续用高斯

我问题解决了，如果你后续还需要的话咱们可以讨论哈~

吴国卿 · 发表于 Post on 2019-11-26 10:31:35

moonlight2690 发表于 2019-11-15 17:12
我问题解决了，如果你后续还需要的话咱们可以讨论哈~

你好，我也是卡在了L402报错了，一直解决不了，请问你是怎么解决的呢？谢谢

skdmax · 发表于 Post on 2019-12-18 17:07:24

moonlight2690 发表于 2019-11-15 17:12
我问题解决了，如果你后续还需要的话咱们可以讨论哈~

你好,请问最后是怎么解决的?我还是报这样的错误.请您指导一下,谢谢

函数与激情 · 发表于 Post on 2020-2-16 14:16:16

本帖最后由函数与激情于 2020-2-16 14:17 编辑

sob老师您好，我将您文中的脚本稍作修改，试图使用openmolcas的CASPT2梯度用高斯的optimizer优化，修改后似乎是可以优化，但是并未在gaussina.log中更新优化圈数，直到最后收敛到四个YES后gaussian.log中也就只有这最后一圈的信息，log中只优化初猜结构和优化收敛的结构。不知道上述是在哪里出了问题，希望sob老师指点一下，不胜感激！

天南海北 · 发表于 Post on 2020-3-17 18:51:44

moonlight2690 发表于 2019-11-15 17:12
我问题解决了，如果你后续还需要的话咱们可以讨论哈~

我也是这个问题，如何解决的？

chenw · 发表于 Post on 2020-9-8 21:31:09

请问，如果将opt和freq同时设定在orca.sh里，是不是不合理的？会不会每一步结构优化都算一遍freq?

snljty · 发表于 Post on 2020-9-8 22:37:10

chenw 发表于 2020-9-8 21:31
请问，如果将opt和freq同时设定在orca.sh里，是不是不合理的？会不会每一步结构优化都算一遍freq?

1.opt和freq应该设在Gaussian的输入文件而不是orca.sh里，orca只负责提供能量和能量一阶二阶导数，优化算法等是Gaussian做的。
2. 应该不会，因为Gaussian每步external传递给外部的输入文件第一行都有个参数，指出这步任务要求做几阶导数。而orca.sh脚本里面也写了，只有什么情况才调用orca做一阶/二阶导数计算并回传信息。不需要的时候自然不会去算。

chenw · 发表于 Post on 2020-9-8 23:25:48

snljty 发表于 2020-9-8 22:37
1.opt和freq应该设在Gaussian的输入文件而不是orca.sh里，orca只负责提供能量和能量一阶二阶导数，优化算 ...

非常感谢，是我看错了；
此外我还有问题想请教一下，社长的orca.sh脚本计算级别中没写RIJCOSX，我自己加上了，合理吗？
此外我还使用了溶剂模型，写的是CPCM(Toluene)
总的内容是：level="B3LYP D3 def2-svp def2/J RIJCOSX CPCM(Toluene)" 。怎么检验溶剂模型已被正确使用？

sobereva · 发表于 Post on 2020-9-9 06:34:51

chenw 发表于 2020-9-8 23:25
非常感谢，是我看错了；
此外我还有问题想请教一下，社长的orca.sh脚本计算级别中没写RIJCOSX，我自己 ...

想加就加

这些本来就是直接传递给ORCA的关键词，必然会被使用。不放心的话检查一下中间产生的ORCA输出文件便知

喵星大佬 · 发表于 Post on 2020-9-9 09:05:53

函数与激情发表于 2020-2-16 14:16
sob老师您好，我将您文中的脚本稍作修改，试图使用openmolcas的CASPT2梯度用高斯的optimizer优化，修改后似 ...

所以你后来问题解决了嘛

函数与激情 · 发表于 Post on 2020-9-9 14:51:02

喵星大佬发表于 2020-9-9 09:05
所以你后来问题解决了嘛

后来我写信咨询了高斯官方，问题得到了解决。
这里的问题是因为External开发时其主要目的是ONIOM计算的low layer，其假设是所调用的计算非常迅速以至于其耗时几乎可以忽略。在这种情况下，如果像通常优化一样每步都要经过几个链接（Link），打印梯度、位移等收敛限信息，调用Link本身的时间虽然很低，但如果External调用的计算几乎不花时间，相对来说Link之间的传递会明显减慢计算速度。因此，使用External优化时默认采用类似分子力场计算的MicroIteration，全部在Link 402中完成，所以不会打印中间信息。External调用CASPT2的梯度计算，花费时间远远超出在几个链接之间跳转的时间，因此可以在优化中关闭 MicroIteration，关键词是“Opt=NoMicro”，这样每步优化都会经过几个Link并打印您要的信息。

喵星大佬 · 发表于 Post on 2020-9-9 16:37:36

函数与激情发表于 2020-9-9 14:51
后来我写信咨询了高斯官方，问题得到了解决。
这里的问题是因为External开发时其主要目的是ONIOM计算的l ...

我记得sob老师这个帖子里和联用xtb的帖子里都是说优化要加opt=nomicro的
也就是你那个脚本可以正常用高斯调用OpenMolca的高级别方法咯

函数与激情 · 发表于 Post on 2020-9-9 21:21:51

喵星大佬发表于 2020-9-9 16:37
我记得sob老师这个帖子里和联用xtb的帖子里都是说优化要加opt=nomicro的
也就是你那个脚本可以正常用高 ...

对的

Scarlett-ww · 发表于 Post on 2021-1-16 22:01:41

吴国卿发表于 2019-11-26 10:31
你好，我也是卡在了L402报错了，一直解决不了，请问你是怎么解决的呢？谢谢

应该是你的orca目录写错了，再仔细检查一下~

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