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楼主 Author: sobereva
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[ORCA] 将Gaussian与ORCA联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析

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发表于 Post on 2021-11-11 22:15:45 | 只看该作者 Only view this author
社长您好,单独的opt或者freq都可以进行计算,opt和freq一起时不能同时进行啊,这是因为软件受限制嘛?

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发表于 Post on 2021-11-11 22:21:33 | 只看该作者 Only view this author
任豹 发表于 2021-11-11 22:15
社长您好,单独的opt或者freq都可以进行计算,opt和freq一起时不能同时进行啊,这是因为软件受限制嘛?

因为Gaussian在做opt freq时,freq默认会从chk文件里读取波函数初猜,然后发现chk里什么都没有,报错...

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发表于 Post on 2021-11-12 10:39:02 | 只看该作者 Only view this author
RAL 发表于 2021-11-11 22:21
因为Gaussian在做opt freq时,freq默认会从chk文件里读取波函数初猜,然后发现chk里什么都没有,报错...

明白了,谢谢

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发表于 Post on 2021-11-14 18:13:39 | 只看该作者 Only view this author
使用orca的版本5.0.1,进行过渡态搜索考虑溶剂模型时
想使用SMD模型!
在orca.sh添加关键词
%cpcm
smd true
SMDsolvent "water"
end
计算失败!
直接使用orca计算是成功的!
报错如下图1
关键词如下图2

但是使用CPCM模型
添加关键词
! CPCM(Water)
计算成功
这是怎么回事?

社长在http://sobereva.com/327中提到隐式溶剂模型下进行自由能计算中说绝对不要在Gaussian里用CPCM
我后面是要计算自由能的!


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-15 02:50:13 | 只看该作者 Only view this author
任豹 发表于 2021-11-14 18:13
使用orca的版本5.0.1,进行过渡态搜索考虑溶剂模型时
想使用SMD模型!
在orca.sh添加关键词

之后你再单独用ORCA结合SMD算能量就完了
本来就不建议opt freq过程中用SMD。在Gaussian里用CPCM和在ORCA里用CPCM完全是两回事,而且对于opt freq的目的在ORCA里本来就建议用CPCM
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发表于 Post on 2021-11-15 09:14:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-15 02:50
之后你再单独用ORCA结合SMD算能量就完了
本来就不建议opt freq过程中用SMD。在Gaussian里用CPCM和在ORCA ...

好的,谢谢sob社长!

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发表于 Post on 2021-11-19 12:19:38 | 只看该作者 Only view this author
RAL 发表于 2021-11-11 22:21
因为Gaussian在做opt freq时,freq默认会从chk文件里读取波函数初猜,然后发现chk里什么都没有,报错...

从Gaussian 16b开始,opt和freq已经可以一起调用external算了

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发表于 Post on 2021-11-19 12:30:36 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian 16.c有个重大修改(也可能是bug)。在oniom计算类型中,旧版EOu/EIn文件只包含external所对应层的原子。而G16.c要求必须包含全部原子(其他层的原子序数为0作为区分),所以目前的各种接口(orca、xtb、cfour、mm)在oniom计算中都有问题。

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发表于 Post on 2022-1-15 10:09:49 | 只看该作者 Only view this author
能在Windows下实现联用吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-15 20:38:39 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2022-1-15 10:09
能在Windows下实现联用吗?

不能(WSL、虚拟机另谈)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-8-26 19:17:54 | 只看该作者 Only view this author
任豹 发表于 2021-11-14 18:13
使用orca的版本5.0.1,进行过渡态搜索考虑溶剂模型时
想使用SMD模型!
在orca.sh添加关键词

虽然SMD不适合opt和freq,不过我改了一个能用SMD的脚本,大家有需要的自取吧。

orca-solv.sh

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发表于 Post on 2022-12-9 11:25:39 | 只看该作者 Only view this author
请问这种方法,版权上允许吗?(有Gaussian版权)

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发表于 Post on 2022-12-13 13:21:28 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好,请教一个问题。我发现通过Gau-ORCA接口来做freq和ORCA直接进行freq任务,两者输出的频率以及ZPE都是不一样的,低频的会差异大些,基于同样的Hessian,传给Gaussian后,为什么会得到和ORCA不一样的频率?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-14 17:33:41 | 只看该作者 Only view this author
nirvana 发表于 2022-12-9 11:25
请问这种方法,版权上允许吗?(有Gaussian版权)

谁管这个
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-14 17:36:08 | 只看该作者 Only view this author
胡说 发表于 2022-12-13 13:21
老师,您好,请教一个问题。我发现通过Gau-ORCA接口来做freq和ORCA直接进行freq任务,两者输出的频率以及ZP ...

得看具体差多少

从Hessian转化到频率中牵扯到一些零碎细节,如坐标变换、单位转换、原子质量等,这些的差异都可能对结果产生一定影响
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