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[配置讨论] 配置服务器问题

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发表于 2018-6-9 22:32:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
需要购买5台服务器用于组件计算集群,主要用于计算Gaussian和VASP等软件。由于钱有限,因此经过考虑和调查后得到如下配置:
服务器采用华为的二手服务器RH2288V2(只支持E5 2600V2系列CPU)的2U服务器准系统,大概2013年生产。配置有双电,原装双路主板,带阵列卡(可做raid 0,1,5),带有2个千兆网口。调查了这款服务器大概在2012年左右推出,性价比可行,主要是原装服务器运行比较稳定。
针对这款服务器,自己配置CPU和内存以及硬盘:
CPU:2680V2* 2  或者2690V2*2 不过2690V2价格较高,功耗也高。2680V2虽然是10核心,但是主频2.8GHZ,性能上比2680V3低20%左右(估计),但是性价比较高。2690V2虽然主频是3.0GHZ,但是功耗高,而且价格比2680V2贵30%,性价比不高。
内存:打算购买二手的DDR3 recc 8g 1333或者1600的内存条,配8条组成64GB。
硬盘:2T SAS 7.2K的硬盘 (二手)3.5寸(2017年生产);或者替换为480G的SSD(全新)。两者的价格差异不大。
请教一下我的配置是否比较合适,同时也请教一下专家和老师几个问题:
1、RH2288V2的2U服务器2013年产的,原装的准系统,是否稳定?是否比自己组装的塔式服务器稳定?主要是考虑到2U的刀片式用机柜好放置。另外组成集群是否一定要阵列卡,不做raid是否也可以?
2、2680V2*2 20核心 的CPU是否用于高斯和vasp计算合适?性价比如何?由于不支持AVX2指令集,速度上是否会慢很多,大概慢多少?
3、DDR3 recc 8g的内存条选1333还是1600比较合适,内存的频率对于计算速度影响有多少?另外,二手的DDR3的1600的内存条12年生产的是否可以买,内存用久了是否会影响速度?DDR3对比DDR4计算速度是否会慢很多,大概会慢多少?
4、对于硬盘的话用于高斯和vasp计算是否有必要上SSD,SSD的速度相比7.2K的SAS快很多?SSD上480G是否合适,用于安装cent os系统和软件计算缓存?二手的SAS 7.2K的硬盘是否合适,硬盘的使用时间对于运算速度肯定有影响,但是不知道对于计算速度的影响有多少?
5、另外也想过上E5 2600V3系列的cpu,列如E5-2678V3的正式版,或者2680V3、2696V3的qs cpu。但是价格上面太贵,不知道对于2680V2系列提升有多大?
以上问题,可能涉及比较多,由于需要组服务器,考虑的比较多,也麻烦了。非常感谢!

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发表于 2018-6-10 01:28:07 | 显示全部楼层
一般这种机架式服务器都是安装在空调机房,CPU、内存、主板这些不容易出问题,让人担心的是硬盘,毕竟7*24h转了五年了,数据无价,换块新的吧。要是白送,又舍不得让旧硬盘闲置,那就做个RAID1,多一份安心;通常情况下,机架式服务器要比自己组装的塔式机更稳定些,但这样的比较并不严格。机架式服务器一般都配有冗余电源,在电源稳定性方面会更胜一筹;但是,在散热方面,塔式服务器明显更优越,所以只能说各有利弊。另外自己组装也可以换成4U的工控机箱,这样可以顺利上架;还有你问20核心的CPU是否适用于高斯和vasp计算?这个问题很尴尬,我只能说一般计算20核也都够用;CPU方面v2系列不支持AVX2指令集,会慢20%左右;内存频率对计算速度影响不大,内存即使用久了也并不会影响速度,还有DDR3和DDR4的差别也不大;给你推荐老师的这两篇博文:
http://bbs.keinsci.com/thread-109-1-1.html
http://bbs.keinsci.com/thread-6310-1-1.html
SSD嘛你根据自己的计算需要取舍,去看这篇博文http://bbs.keinsci.com/thread-7478-1-1.html
另外,二手硬盘不是担心他的速度,速度不会有影响,担心的是它的寿命
最后一个问题,能买V3就不要选V2,V3性能有明显提升。

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发表于 2018-6-10 02:30:20 | 显示全部楼层
用经费买吗?头一次买服务器竟然还是二手?胆子好大呀

另外听说VASP对内存速度比较敏感

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发表于 2018-6-10 03:01:34 | 显示全部楼层
v2现在是白菜价,稍微好点的v3一颗U都顶v2一台整机。如果经费捉襟见肘,且卖家的v2老服务器价格确实便宜,买v2是很好选择,从性价比来说无疑远高于买v3新机子。
AVX2的问题相对来说不是那么关键,毕竟v2的性价比优势实在太明显,先用v2的老机子挺几年,等以后条件好了再买新机子,直接上AVX512了。

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 楼主| 发表于 2018-6-10 10:54:28 | 显示全部楼层
一颗赛艇 发表于 2018-6-10 02:30
用经费买吗?头一次买服务器竟然还是二手?胆子好大呀

另外听说VASP对内存速度比较敏感

不是经费购买

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 楼主| 发表于 2018-6-10 10:55:24 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2018-6-10 03:01
v2现在是白菜价,稍微好点的v3一颗U都顶v2一台整机。如果经费捉襟见肘,且卖家的v2老服务器价格确实便宜, ...

谢谢老师,因为好多超算中心的设备都是V2的,极少数的有V3的。

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 楼主| 发表于 2018-6-10 10:59:17 | 显示全部楼层
zyzhang 发表于 2018-6-10 01:28
一般这种机架式服务器都是安装在空调机房,CPU、内存、主板这些不容易出问题,让人担心的是硬盘,毕竟7*24h ...

谢谢了,确实没钱。塔式占有地方。2U的其实我算过,2680V2 95w,2颗是190我,加上其他的满载不会超过250w。所以散热问题倒不是很大。
另外硬盘我觉得SSD的话可以买新的,480G在500左右;2T 的SAS 7.2K的也在550左右(二手库存)。主要是SSD的话容量不太够,新的寿命肯定没有问题。2T的硬盘容量够了,但是比较是二手库存。
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