[Gaussian/gview] 求助：过渡态优化后自旋布局和理论冲突

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发表于 Post on 2018-8-11 11:37:00 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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本帖最后由哈哈哈于 2018-8-12 10:57 编辑

我实在是不知道接下来怎么做了，麻烦老师们给些建议。我做代谢路径的分析，这个反应中有两个过渡态ts1，ts2，我之前由IRC走出来的反应物产物结构是我想要的，但分析它们的自旋布局的时候，发现他们的自旋布局和我根据相关文献理解的不同，感觉前后不匹配。
然后我用非标准路径提取了IRC的每帧的自旋布局，ts1的底物去H 这部分在ts1过程迁移走一个电子到Fe+O，留下的自旋布局为正。在ts2这个过程中由底物去H 这部分再迁移一个电子到 SH+Por 处，从自旋布局看有电子迁移，但这里的底物去H 这部分的自旋布局原来是正现在直接是负的了，Por+SH 那里也相应变了，这种怎么办？前后不匹配。

ts1

ts2

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