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[Gaussian/gview] 在有原子固定的情况下计算频率出现虚频

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基底原子固定的条件下,优化结构计算频率后出现一个虚频。如果按照网上说的调整坐标,那么基底原子的坐标也跟着发生变化,与原意不符合。
请问大神有没有什么好办法在不改变基底原子坐标的情况下消除虚频?
谢谢。

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发表于 Post on 2015-5-8 02:26:27 | 只看该作者 Only view this author
如果你的虚频对应的振动模式涉及到基底原子,那么从原理上就不可能又保持基底原子固定又消掉虚频,
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-9 00:56:58 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
谢谢大神。我的虚频对应的振动不包括基底原子,请问如何解决?

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发表于 Post on 2015-5-9 05:54:47 | 只看该作者 Only view this author
取最后结构先用opt=tight int=ultrafine继续优化,如果还有虚频,用opt=calcfc,如果还不行,用opt=calcall,肯定能解决。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-9 09:06:57 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-5-9 05:54
取最后结构先用opt=tight int=ultrafine继续优化,如果还有虚频,用opt=calcfc,如果还不行,用opt=calcall ...

非常感谢大神。这个办法头一次听说,我试试。

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发表于 Post on 2017-5-19 17:40:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-5-8 02:26
如果你的虚频对应的振动模式涉及到基底原子,那么从原理上就不可能又保持基底原子固定又消掉虚频,

老师 我冻结原子后 就在冻结的原子那出现了两个虚频 请问这种情况该如何解决呢

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发表于 Post on 2017-5-19 17:50:08 | 只看该作者 Only view this author
好好学习 发表于 2017-5-19 17:40
老师 我冻结原子后 就在冻结的原子那出现了两个虚频 请问这种情况该如何解决呢

没法解决,这本来就是必然会存在的。
如果虚频牵扯的不是你感兴趣的原子区域可以姑且忽略
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发表于 Post on 2017-5-22 10:36:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-5-19 17:50
没法解决,这本来就是必然会存在的。
如果虚频牵扯的不是你感兴趣的原子区域可以姑且忽略

谢谢老师

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发表于 Post on 2025-7-10 10:17:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-5-19 17:50
没法解决,这本来就是必然会存在的。
如果虚频牵扯的不是你感兴趣的原子区域可以姑且忽略

我想请问一下sob老师,那在这种情况下如果想做自由能校正的话应该如何处理呢,还是说在固定原子处出现小虚频就无法进行自由能校正呢?

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发表于 Post on 2025-7-10 13:11:29 | 只看该作者 Only view this author
菜呵呵 发表于 2025-7-10 10:17
我想请问一下sob老师,那在这种情况下如果想做自由能校正的话应该如何处理呢,还是说在固定原子处出现小 ...

算完Hessian以后,把基底原子的贡献投影掉,再计算频率、热化学校正等。但不是所有程序都支持这么做
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2025-7-10 13:44:31 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-7-10 13:11
算完Hessian以后,把基底原子的贡献投影掉,再计算频率、热化学校正等。但不是所有程序都支持这么做

谢谢您的解答,但是我还有一点疑问,投影掉基底原子的贡献是指不考虑其对热力学校正的贡献,是这个意思么,还有如果是在Gaussian中如何进行这一操作呢

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