计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 7272|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 分子筛团簇模型,活性区域设置问题求助。

[复制链接 Copy URL]

9

帖子

0

威望

103

eV
积分
112

Level 2 能力者

我最近在做MTO反应的课题,遇到了这样一个问题。选取的是分子筛团簇模型,查阅了很多文献,大多数人在选取活性区域位置时,是将反应分子及周围的5T,6T分子设置成高活性区域,其余部分设置成低活性区域。对于这样选择的原因,他们也没具体给出,观察他们的模型,并没看出有什么样的选取原则。在这里我以LEV分子筛为例。图一是一种情况,而图二是另一种情况,请问一下有经验的前辈们,活性区域该怎么设置呢?

微信截图_20180827194155.png (212.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 24)

图一

图一

微信截图_20180827194829.png (245.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 36)

图二

图二

516

帖子

1

威望

5054

eV
积分
5590

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2018-8-27 20:50:57 | 只看该作者 Only view this author
原因很简单啊,一般是反应中心T原子,加周围的4个氧,再加这4个氧连的T原子。理由就是计算者认为的反应活性位置呗。至于在ONIOM模型中,要说选多大合适,当然是越大越好,但是要考虑高层的计算量,不少文献里会比较高层的不同选择方法对结果的影响的。
另外,没看出你两个图的区别,没有把高层和低层显示出来。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
jnnn16 + 4 谢谢

查看全部评分 View all ratings

9

帖子

0

威望

103

eV
积分
112

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-27 21:20:12 | 只看该作者 Only view this author
niobium 发表于 2018-8-27 20:50
原因很简单啊,一般是反应中心T原子,加周围的4个氧,再加这4个氧连的T原子。理由就是计算者认为的反应活性 ...

非常感谢你的回复按照你所说的,反应中心T原子应该指的是酸性位点旁边的硅、铝和周围四个氧,还有O连的Si吧?我把刚刚的高层和低层标注了出来,高亮的部分就是高活性区域。老师想让我考虑一下笼中酸位点的情况,一时间我就不太知道这个活性区域该如何选择了。还有我在计算时,用的是DMol3模块,我在处理时是想把高亮部分放松,其余原子固定住,不知这么做是否合适?

微信截图_20180827211938.png (212.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 29)

图一

图一

微信截图_20180827211843.png (167.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

图二

图二

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 21:19 , Processed in 0.175993 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list