有没有能够实现Morse势和谐振势混用的程序

喵帕斯 · 发表于 Post on 2018-9-9 15:22:35

最近在做的一个体系，需要使用Au-S键的参数，但是文献中给出的参数是Morse势，所以想问一下有没有程序可以实现Morse和谐振势混用。

ruanyang · 发表于 Post on 2018-9-9 21:01:47

你可以使用lammps软件中的 pair_style hybrid https://lammps.sandia.gov/doc/pair_hybrid.html

ulosggs · 发表于 Post on 2018-9-9 23:33:46

Lammps 楼上说的 pair_style hybrid
GROMACS bond 可以用 table 形式
OpenMM可以用 CustomBondForce

sobereva · 发表于 Post on 2018-9-10 04:15:16

GROMACS里直接支持Morse形式的bond项（functype 3），把拓扑文件里不同的bond用不同的functype即可

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[综合交流] 有没有能够实现Morse势和谐振势混用的程序