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[GROMACS] GROMACS适用范围请教

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发表于 2018-9-12 16:01:35 | 显示全部楼层 |阅读模式
1、在之前看到的文献中有看到当尺度超过100nm时,分子动力学就不再适用,请问GROMACS在建模时边长是不是要小于100nm?2、在官网上查到GROMACS多用于溶液体系或者是晶体,但是由于GROMACS内置了大量水分子模型,因此我想用它来做气态下水分子的成核和凝并,并且已经初见效果,请问GROMACS可以这么做吗?

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发表于 2018-9-12 16:31:18 | 显示全部楼层
适用范围跟尺寸没有直接关系。尺度的上限纯粹是计算量层面的事,你算得动就能用
模拟气态团簇是极为适合的
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 楼主| 发表于 2018-9-12 20:03:29 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2018-9-12 16:31
适用范围跟尺寸没有直接关系。尺度的上限纯粹是计算量层面的事,你算得动就能用
模拟气态团簇是极为适合的

好的 谢谢sob老师,最近做的有点心慌慌
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