关于IGM考察主-客体复合物中的弱相互作用的例子

lira

1.为什么我单独做载入IGM_inter.vmd脚本的例子时，里面的形成的圆片都是灰色的？ 并且如果有了色彩，那么圆片的大小和颜色能说明什么问题呢？
2.把dg_inter.cub和atmdg.pdb都拖入VMD后，我按照教程做完，红白色的环和内部的分子都正常，为啥两者之间形成的绿色区域，我这里面显示的是碎屑呢。还是说载入dg_inter.cub的时候，应该是把dg_inter.cub和sl2r.cub一起放到VMD文件里，用IGM_inter.vmd脚本打开，才有和之前一样的圆片产生呢？
求教求教。

三石草祭

楼主，我想咨询下您研究主客体之间的弱相互作用的意义是什么呢，有弱相互作用更容易能量传输还是说可以改变光学性质呢

sobereva

1 如果你100%确定操作过程无误，可能是VMD与显卡兼容性问题，换个机子再试
圆片大小体现存在显著相互作用的区域面积，颜色的含义在博文里有详述

2 看不懂你的描述。仔细、严格按照博文操作，博文应当写得没有任何歧义，如果还不明白、重复不出来博文里的例子，做手册4.20.10节的例子

lira

sobereva 发表于 2018-9-23 22:34
1 如果你100%确定操作过程无误，可能是VMD与显卡兼容性问题，换个机子再试
圆片大小体现存在显著相互作用 ...

感谢您的回答
我再按照您的建议尝试做。