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[蛋白质建模] 请教GPCR结构中氨基酸位置编码问题

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楼主
各位老师请教一下,我在调研一些关于GPCR的结构文献时,经常看到作者在具体的定位某个氨基酸时会这样写,如Gln6.30,Arg3.15这样的描述。我知道这里面的6和3分别代表着螺旋6和螺旋3,但是关于整数后面跟着的小数到底是如何定义的不是非常清楚。它是从氨基酸链的N端到C端还是相反以及这些数值的大小到底是如何确定的我没有查到相关的信息,希望知道的大神多多指教,非常感谢!

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发表于 Post on 2023-11-23 16:54:42 | 只看该作者 Only view this author
每个AA标识符都以TMH编号开始,例如TMH4的编号为4,其次是该TMH中最保守的AA相对于参考残基的位置。参考余数被分配为50。例如,TMH4中最保守的AA是一个标识符为4.50的色氨酸,即W4.50。在W4.50之后的5个AA的丝氨酸残基值是S4.55 。

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