优化完分子的结构变形特别大，可能是什么原因，该怎样解决呢？

CocuLiu

MS中 Dmol3模块计算两个分子。
第一步构建一个空的立方体晶体盒子（65*65*65），放两个分子放进去后（放在盒子中间），进行优化任务（GGA-PBE,DNP,,,,use DFT-D, use spin unrestricted , use Multiplicity=Doublet,  use symmetry,  use DIIS,,   Quality均为fine）,,,在这样的设置下，优化完分子的结构变形特别大。导致无法利用优化完的结构  跑Dynamics。
请问老师这有可能是什么原因，该怎样解决呢？

sobereva

算分子体系设盒子启用周期性纯粹多此一举自找麻烦

看http://bbs.keinsci.com/thread-10554-1-1.html

CocuLiu

谢谢您，老师。