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[新手求助] 如何计算一部分分子的偶极矩来进行向量叠加?

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老师,您好,在计算偶极矩的过程中,看到文章中由计算一个分子的两部分然后通过矢量叠加得到整个分子的偶极矩,相关文字与图示如下图所示,我知道整个分子的偶极矩如何计算,但是如何计算一部分分子的偶极矩来进行向量叠加?感谢老师的回复。

1543321916(1).png (36.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 49)

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发表于 Post on 2018-11-27 21:20:30 | 只看该作者 Only view this author
可以提供一下文章信息吗,搜文字和图片居然没搜到,想了解一下相关的东西,谢谢!

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发表于 Post on 2018-11-27 21:48:18 | 只看该作者 Only view this author
用Multiwfn计算ADCH电荷,产生.chg文件,此文件里将含有原子电荷信息。将.chg载入Multiwfn时,屏幕上就会提示基于原子电荷计算的偶极矩。手动将.chg中另一个片段部分删除,则载入Multiwfn显示的就是剩下的片段的偶极矩。因此可以容易地计算两个片段各自的偶极矩。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-27 22:19:52 | 只看该作者 Only view this author
adia 发表于 2018-11-27 21:20
可以提供一下文章信息吗,搜文字和图片居然没搜到,想了解一下相关的东西,谢谢!

你好,文章为Adv. Mater. 2018, 30, 1800052

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-27 22:24:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-27 21:48
用Multiwfn计算ADCH电荷,产生.chg文件,此文件里将含有原子电荷信息。将.chg载入Multiwfn时,屏幕上就会提 ...

谢谢老师的回复,我按照您说的方法计算一下,还有一个问题需要麻烦老师帮忙,在优化分子的过程中,如何在考虑分子中的非共价相互作用的情况下得到最优构象?即优化分子的过程中如何将非共价相互作用考虑在内?

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发表于 Post on 2018-11-27 22:37:17 | 只看该作者 Only view this author
落花飘雨679 发表于 2018-11-27 22:24
谢谢老师的回复,我按照您说的方法计算一下,还有一个问题需要麻烦老师帮忙,在优化分子的过程中,如何在 ...

你的计算级别若能合理描述弱相互作用,自然而然就考虑了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-27 22:44:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-27 22:37
你的计算级别若能合理描述弱相互作用,自然而然就考虑了

老师,我懂了,如果这个体系中存在弱相互作用,我用考虑弱相互作用的泛函来计算就可以了。谢谢您的耐心解答。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-29 19:27:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-27 21:48
用Multiwfn计算ADCH电荷,产生.chg文件,此文件里将含有原子电荷信息。将.chg载入Multiwfn时,屏幕上就会提 ...

老师您好,我用您说的方法将.chg文件导入Multiwfn中,显示总的偶极矩为 0.094789 Debye,而用高斯得到的结果为 0.1728Debye,请问老师我要以哪个结果为准?谢谢老师。

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发表于 Post on 2018-11-29 23:32:18 | 只看该作者 Only view this author
落花飘雨679 发表于 2018-11-29 19:27
老师您好,我用您说的方法将.chg文件导入Multiwfn中,显示总的偶极矩为 0.094789 Debye,而用高斯得到的 ...

是bug,计算的时候单位转换疏忽了,我已经修复了并在官网上更新了程序。谢谢发现这个bug
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-11-30 08:14:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-29 23:32
是bug,计算的时候单位转换疏忽了,我已经修复了并在官网上更新了程序。谢谢发现这个bug

现在一致了,谢谢老师,老师我如果手动删掉了原子,计算其中一部分的偶极矩,这部分偶极矩的方向通过什么方法确定呢?

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发表于 Post on 2018-11-30 11:04:21 | 只看该作者 Only view this author
落花飘雨679 发表于 2018-11-30 08:14
现在一致了,谢谢老师,老师我如果手动删掉了原子,计算其中一部分的偶极矩,这部分偶极矩的方向通过什么 ...

就是∑R(i)q(i)方式计算,R是原子坐标矢量,q是原子电荷,加和是对于chg里所有原子而言的
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