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[Multiwfn使用咨询] Multiwfn 结合VMD作图的一点问题

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请问:如何将分子显示出来,换句话说,怎么只看分子间的相互作用?

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发表于 Post on 2018-12-16 20:29:44 | 只看该作者 Only view this author
卢老师在博文里面写了怎么操作
当然 最简单的就是做IGM 分析
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-16 20:31:02 | 只看该作者 Only view this author
我是初学者 能不能说的详细点

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发表于 Post on 2018-12-16 20:34:25 | 只看该作者 Only view this author
那你还是做IGM分析吧 http://sobereva.com/407
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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发表于 Post on 2018-12-16 23:58:08 | 只看该作者 Only view this author
看博文要仔细

使用Multiwfn图形化研究弱相互作用
http://sobereva.com/68



北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-12-17 10:29:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-16 23:58
看博文要仔细

使用Multiwfn图形化研究弱相互作用

请教一下sobereva老师,初始的xyz文件只能通过分子动力学模拟得到么?比如我想计算有机物的弱相互作用,可否通过ms建立晶胞或者建立无定型胞,然后保存xyz文件通过multiwfn模拟计算分子间的弱相互作用。还是一定要跑分子动力学,因为多分子动力学没有接触过。非常感谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-17 10:54:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-16 23:58
看博文要仔细

使用Multiwfn图形化研究弱相互作用

感谢sob老师,问题已经解决。是我自己 太大意了。

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发表于 Post on 2018-12-18 03:59:57 | 只看该作者 Only view this author
xaomidaxue 发表于 2018-12-17 10:29
请教一下sobereva老师,初始的xyz文件只能通过分子动力学模拟得到么?比如我想计算有机物的弱相互作用, ...

显然不限于分子动力学得到,而且分子动力学得到的仅仅是用于aRDG的目的,对于一般的RDG/IGM分析并不适合
计算程序直接优化的结构转成xyz文件直接就可以用与RDG/IGM
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-12-18 09:53:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-12-18 03:59
显然不限于分子动力学得到,而且分子动力学得到的仅仅是用于aRDG的目的,对于一般的RDG/IGM分析并不适合
...

非常感谢老师

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