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[Gaussian/gview] 关于二面角柔性扫描的问题

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楼主
各位老师们好!我现在有个D-A-D结构的分子,基态优化后D-A的二面角是37度。我打算对两个D-A二面角同时进行扫描。
我之前的方法是:

%nprocshared=10
%mem=16GB
%chk=dihedral-scan.chk
# opt=modredundant b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity
......
中间省略
......
D 14 13 31 30 S 9 20.000000
D 9 8 26 27 S 9 20.000000



但是这样有两个问题:
首先它不是从0度开始扫描的,而是从37度开始的,然后依次57,77,97,117,137,157,177,197,217的构型,作图不太好看。
其次,这样同时设定两个二面角的话,需要扫描100次,而我实际上只需要两个二面角相同的10个结构而已,计算量增加了10倍!

所以我想问一下,能否对两个二面角同时进行柔性扫描的时候,保持两个二面角大小始终保持一致,然后扫描从0度开始,每20度一个间隔,分别得到0,20,40,60,80,100,120,140,160,180的构型数据。请问我应该怎样设置?

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发表于 Post on 2019-1-16 12:14:45 | 只看该作者 Only view this author
从哪个度数开始扫取决于你的初始结构,初始结构放成20,扫的就是20、40、60...
两个变量协同扫描可以设法使用G16的GIC,不过鉴于你只需要做十个结构,不妨就手动调出10个初猜结构,使得两个二面角处于想要的角度,然后做十个限制性优化。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-16 16:35:15 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 seantan521 于 2019-1-17 03:05 编辑
liyuanhe211 发表于 2019-1-16 12:14
从哪个度数开始扫取决于你的初始结构,初始结构放成20,扫的就是20、40、60...
两个变量协同扫描可以设法 ...

李老师您好,参考了http://sobereva.com/404http://gaussian.com/opt/两处说明后,我利用GIC写了协同扫描的关键词。麻烦你帮我看下这样写的对不对,或者您有什么更好的写法建议?谢谢老师

%nprocshared=10
%mem=16GB
%chk=dihedral-scan.chk
# opt=(modredundant,addgic) b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity
......
中间省略
......
D 15 9 7 8 S 6 30.000000
D 5 6 8 7 S 6 30.000000

D001=D(15,9,7,8)
D002=D(5,6,8,7)
rcons(freeze)=D001-D002


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-16 16:45:50 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 seantan521 于 2019-1-17 03:01 编辑
liyuanhe211 发表于 2019-1-16 12:14
从哪个度数开始扫取决于你的初始结构,初始结构放成20,扫的就是20、40、60...
两个变量协同扫描可以设法 ...

李老师,还有关于限制性优化的写法,是不是这样的:

(先手动把二面角设置成自己要求的大小,比如从0度开始)

%nprocshared=10
%mem=16GB
%chk=dihedral-scan.chk
# opt=modredundant b3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity
......
中间省略
......
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