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[新手求助] 关于高斯log文件中出现Error: segmentation violation怎么解决

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楼主
我的高斯log文件中出现
Error: segmentation violation
   rax 0000000000000000, rbx ffffffffffffffff, rcx ffffffffffffffff
   rdx 0000000000004ff5, rsp 00007fffae8acd48, rbp 00007fffae8ad320
   rsi 000000000000000b, rdi 0000000000004ff5, r8  00002ab2d275dca0
   r9  0000000000000000, r10 00007fffae8acad0, r11 0000000000000206
   r12 0000000000000000, r13 0000000000000000, r14 00007fffae8ad368
   r15 0000000001af0d48
  --- traceback not available
我的输入文件是

%nprocshared=24
%mem=30GB
%chk=re_II_Fe_III_2state_1_Fragmentguess.chk
#p ub3lyp/genecp nosymm pop=always Guess(Fragment=5)


谢谢大神


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发表于 Post on 2019-1-24 16:05:07 | 只看该作者 Only view this author
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

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3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-24 17:32:47 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2019-1-24 16:05
http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html

感谢感谢  

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发表于 Post on 2019-7-12 07:32:31 | 只看该作者 Only view this author
楼主你的问题解决了么?
越努力越幸运!

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发表于 Post on 2020-1-6 09:23:03 | 只看该作者 Only view this author
xylz6188 发表于 2019-7-12 07:32
楼主你的问题解决了么?

楼主and这位兄弟你的解决了吗,我的出现了

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发表于 Post on 2022-6-14 18:26:31 | 只看该作者 Only view this author
xylz6188 发表于 2019-7-12 07:32
楼主你的问题解决了么?

这句话是分段错误,
应该是你的开头的核数,内存什么的写错了,或者是安装高斯的时候,Default.Route这个配置的计算资源哪里错了

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7#
发表于 Post on 2022-7-23 21:34:46 | 只看该作者 Only view this author
请问我写的时候没有分配核数和内存,我听其他人说是自动分配最大的核数和内存,我用小分子算的时候也确实是这样子,没有报错,但是算大分子,算了4个小时就报错了这个错,我打开log文件里面也没有细说是什么错误,这样写有什么问题吗?(开头写的是%chk=xxx.chk)

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8#
发表于 Post on 2022-7-24 00:18:20 | 只看该作者 Only view this author
RES 发表于 2022-7-23 14:34
请问我写的时候没有分配核数和内存,我听其他人说是自动分配最大的核数和内存,我用小分子算的时候也确实是 ...

segmentation violation的报错原因是极其多的,并不是所有segmentation violation都是你楼上提到的原因。还是要结合http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html分析
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2022-7-24 12:25:41 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-24 00:18
segmentation violation的报错原因是极其多的,并不是所有segmentation violation都是你楼上提到的原因。 ...

老师你好,我仔细查看了一下,发现是SCF不收敛的原因导致的,之前我的计算都是在windows下面用Gaussview搭好结构,然后把gjf放到Linux远程进行计算,没有用什么关键词,一直都不会报错,这次我直接在Linux下vi编辑gjf,然后原子坐标用的是Nanotube modeler里面保存出来的坐标,我想的是会不会是Nanotube medeler 里面的原子坐标太过分散,导致不好收敛吗?

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发表于 Post on 2022-7-24 15:17:07 | 只看该作者 Only view this author
RES 发表于 2022-7-24 05:25
老师你好,我仔细查看了一下,发现是SCF不收敛的原因导致的,之前我的计算都是在windows下面用Gaussview ...

那需要你仔细检查你的结构了,Nanotube modeler的原子坐标不是必然过于分散,必须靠你自己检查。
如果结构没有问题,包括原子的单位(埃、Bohr)也没问题的话,按照http://sobereva.com/61的方法依次尝试,把所有方法尝试了、没有遗漏哪怕一个方法,仍然不收敛,再来问
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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发表于 Post on 2022-7-25 22:27:47 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢老师

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