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[建模与可视化] 请问有没有什么画图软件能很好的去给一个大分子中的某几个原子来改色

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老师您好,请问有什么画图工具能很好的去给一个分子中某几个原子来调色的吗?(相同的原子有很多,但是只想把其中几个给单独的高亮表示出来,Gview高亮后 有序号不想要)。请老师指点,谢谢老师~

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发表于 Post on 2019-1-26 07:50:00 | 只看该作者 Only view this author
BIOVIA Discovery Studio Visualizer, Chem3D可以做

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发表于 Post on 2019-1-26 16:35:28 | 只看该作者 Only view this author
VMD, create rep -> select

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发表于 Post on 2019-1-26 17:21:27 | 只看该作者 Only view this author
在这方面VMD完爆任何其它程序。没有哪个程序在显示方式设置的灵活度方面能与VMD相提并论。诸如DS和Chem3D简直弱爆了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2019-1-26 18:29:21 | 只看该作者 Only view this author
VMD是最好的,不过懒的话,GV里也能通过Group实现可以接受的高亮效果




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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-27 10:39:57 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2019-1-26 18:29
VMD是最好的,不过懒的话,GV里也能通过Group实现可以接受的高亮效果

非常感谢您,只是怎么能把Gview的结果弄到VMD里,这个格式没法转换。您有什么办法吗?

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truffle

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发表于 Post on 2019-1-27 14:05:26 | 只看该作者 Only view this author
cqu_xiaoq 发表于 2019-1-27 10:39
非常感谢您,只是怎么能把Gview的结果弄到VMD里,这个格式没法转换。您有什么办法吗?

GV里面File-Save把分子另存为pdb、xyz、mol等格式都可以被VMD载入的,再在VMD里面改显示就好了。
No problem is insoluble in all conceivable circumstances.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-27 15:11:05 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2019-1-27 14:05
GV里面File-Save把分子另存为pdb、xyz、mol等格式都可以被VMD载入的,再在VMD里面改显示就好了。

好的,感谢

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