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[同源模建] 请教:Swiss-model 和 Modeller 建模质量比较

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264

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272

Level 3 能力者

发表于 2019-2-9 16:03:54 | 显示全部楼层 |阅读模式
我有一段大约100个氨基酸的蛋白质,需要进行建模,用Swiss-model查询模板序列同源性最好的是41%,想请问大家在这种情况下用Swiss-model 和 Modeller建模哪个更好一些?
另外还想问下评价建模质量用那些指标更好?谢谢大家

204

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3

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2722

eV
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2986

Level 5 (御坂)

发表于 2019-2-10 18:42:06 | 显示全部楼层
试试Rosetta ab inito. 100AA 41%同源性,最后出来的模型精度应该不错

评分

参与人数 1eV +1 收起 理由
李德贤 + 1 谢谢

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主攻: 蛋白-蛋白对接,蛋白de novo设计、蛋白结构建模,抗体设计等方向。Rosetta/PyRosetta

6

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43

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49

Level 2 能力者

发表于 2019-3-24 19:33:51 | 显示全部楼层
都做同源建模,最后通过评分看哪个好呀
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