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[新手求助] 求助 Gaussian模拟无报错终止

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各位老师大家好,本人刚刚接触模拟,刚刚接触高斯,所以不是特别懂,如果问题比较低级,也请各位大哥哥大姐姐们帮帮忙。
最近在做分子在溶剂效应下的结构优化,下面会附上gjf文件,是一个38原子的模拟。在Linux下的高斯,模拟12个小时之后,停在No special actions if energy rises处,之前查阅资料后了解到,scf迭代时间长,不属于报错,但是Linux下用top查看,进程已经结束了。打开log文件并没有任何报错。又重新提交计算了几次,结果还是无报错自动终止。恳请大家帮忙解决。谢谢了。

问题.jpg (119.68 KB, 下载次数 Times of downloads: 78)

问题.jpg

模拟gjf.txt

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发表于 Post on 2019-2-21 15:32:03 | 只看该作者 Only view this author
16核才给500MB内存太小,内存剩多少给多少,例如剩40G起码给个35G


斜线用对了


基组垃圾


不懂啥意思的关键词就不要写。要么弄懂了再写,要么去掉



仔细阅读:谈谈量子化学中基组的选择

http://sobereva.com/336

我不确定无报错退出的原因具体是哪一个,但先改了试试再说

高斯常做的计算一般都不宜叫“模拟”

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-2-22 10:39:28 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2019-2-21 15:32
16核才给500MB内存太小,内存剩多少给多少,例如剩40G起码给个35G

斜线用对了

收到您的回复,我十分激动,因为实验室没人会用高斯,十分感谢您!我昨天早上又尝试计算了一次,这次设置了20GB的内存,结果还是无报错终止。log文件只有49K,关于基组选择问题,的确像您推荐的帖子所说,盲目跟从文献,没有自己思考,会按照您的建议自己选取基组。关键词是用GV提交之后,自动添加的,也会修改。这是昨天早上做的计算,这次没有溶剂化,只是结构优化,结果又一次无报错终止,上传了输入文件和log文件,您能再帮我看看嘛,十分感谢您。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-2-22 10:40:35 | 只看该作者 Only view this author
麻烦大神再帮我看看吧,谢谢您了

zfbj1.log

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zfbj1.gjf

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发表于 Post on 2019-2-22 11:12:17 | 只看该作者 Only view this author
三三33 发表于 2019-2-22 10:40
麻烦大神再帮我看看吧,谢谢您了

liyuanhe211大神给你的回复你没认真看,他给的sob的链接你也没(认真)看。斜线错误和基组问题等等一堆问题。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2019-2-22 12:03:34 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2019-2-21 15:32
16核才给500MB内存太小,内存剩多少给多少,例如剩40G起码给个35G

斜线用对了

高斯常做的计算一般都不宜叫“模拟”

为啥呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-2-22 12:19:38 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2019-2-22 11:12
liyuanhe211大神给你的回复你没认真看,他给的sob的链接你也没(认真)看。斜线错误和基组问题等等一堆问 ...

好好,谢谢您,我会认真仔细的看一看。

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发表于 Post on 2019-2-22 23:02:11 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-2-22 12:03
高斯常做的计算一般都不宜叫“模拟”

为啥呢?

“模拟”更适合用于形容分子模拟方面的计算
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-2-23 09:19:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-2-22 23:02
“模拟”更适合用于形容分子模拟方面的计算

谢谢您的解答,十分感谢

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发表于 Post on 前天 19:23 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2019-2-21 15:32
16核才给500MB内存太小,内存剩多少给多少,例如剩40G起码给个35G

斜线用对了

您好,可以帮我看一下这个吗,也是没有报错但是突然终止
%chk=2a+VI_RS2_rx_scan.chk
%nprocshared=32
%mem=32GB
# opt=modredundant 6-31g(d) m062x

Title Card Required

-1 1
C                  6.09873394    4.08523631   -3.41784972
C                  6.33141180    5.33923904   -2.96881592
C                  7.54371867    6.08101792   -3.16178751
C                  5.47589489    5.86931110   -2.09875325
H                  4.52654008    5.29553131   -2.11954591
O                  5.50110681    7.04992772   -1.86569192
N                  8.51510164    6.69282448   -3.30879205
H                  5.11099631    3.69530993   -3.16691180
C                  6.92664715    3.15571057   -4.17749416
C                  6.36333463    1.90590410   -4.48344946
C                  8.23343919    3.43331141   -4.61376184
C                  7.07647748    0.95690251   -5.20250311
H                  5.35306558    1.68399068   -4.14939215
C                  8.94317985    2.48111869   -5.33276826
H                  8.69722069    4.38730056   -4.39472002
C                  8.37076813    1.24460065   -5.62897783
H                  6.62519054   -0.00328342   -5.42966618
H                  9.95141274    2.70622325   -5.66458045
H                  8.93391119    0.50673388   -6.19172360
C                  7.40298823    6.21067123   -1.31160888
C                  7.19563723    4.79815323   -1.82420988
C                  8.33032423    4.37351123   -2.49537288
C                  9.39217223    5.27144823   -2.44737988
C                  8.95523523    6.37934223   -1.46919188
H                  7.22391069    5.34644912   -0.66369507
H                  8.35788823    3.41335523   -3.00252588
C                 10.69553423    5.13421423   -3.05296388
C                 11.74684723    6.06070523   -2.85813888
C                 10.98756923    4.03442923   -3.89879988
C                 12.99094623    5.88978223   -3.45410388
H                 11.58861123    6.93826723   -2.24056888
C                 12.23085423    3.87076323   -4.48546688
H                 10.21239723    3.30091823   -4.09749388
C                 13.25604823    4.79501923   -4.27182988
H                 13.76424823    6.63268423   -3.27339288
H                 12.40305623    3.00761123   -5.12450188
H                 14.22931023    4.66576323   -4.73524388
C                  6.95108302    7.29873062   -0.35785436
C                  6.34818731    6.97544616    0.85669572
C                  7.06437527    8.64781156   -0.71347189
C                  5.85605346    7.97110732    1.69894165
H                  6.23925937    5.92829520    1.12702394
C                  6.58597791    9.64504688    0.12950709
H                  7.52231313    8.90231427   -1.66663619
C                  5.97459749    9.30952798    1.33838235
H                  5.37135180    7.69917361    2.63245741
H                  6.68355233   10.68783021   -0.15976169
H                  5.59008419   10.08829677    1.99138763
C                  5.97725823    4.06905723   -1.76233288
C                  9.35081323    7.75542323   -1.79580388
N                  9.69187423    8.84326623   -1.99793788
C                  9.66399523    5.94599323   -0.17882588
H                 10.76776823    5.91826323   -0.26080588
O                  9.09548823    5.56815123    0.81637412
O                  5.72586923    2.96903023   -2.23442288
O                  5.00794223    4.77794823   -1.05497188
C                  3.71621723    4.21740623   -1.07118088
H                  3.78444723    3.12544823   -1.09650488
H                  3.24239523    4.52177823   -0.13064088
C                  2.30858748    4.65048266   -1.42877275
C                  1.22554576    4.11939866   -0.72389802
C                  2.06946910    5.58957258   -2.42992483
C                 -0.07496154    4.52070543   -1.01007586
H                  1.40573648    3.38012198    0.05474017
C                  0.76658362    5.99117035   -2.71882852
H                  2.90499069    6.00455243   -2.98453331
C                 -0.30886124    5.46205741   -2.01173192
H                 -0.90733037    4.09628275   -0.45494763
H                  0.60375918    6.72575475   -3.50282031
H                 -1.32375105    5.77650985   -2.23891629

B 2 21 S 10 0.100000









内存和核数换到8核心32GB也不行

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发表于 Post on 前天 21:15 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 xcgotk 于 2026-7-9 21:22 编辑
Lsjin 发表于 2026-7-9 19:23
您好,可以帮我看一下这个吗,也是没有报错但是突然终止
%chk=2a+VI_RS2_rx_scan.chk
%nprocshared=32
...



最好先优化好初始构型吧,我用半经验跑着是没问题的,或许是更好的方法要求更高,到了某一步没收敛导致退出,当然毕竟我比较菜鸡,反正肯定要先优化的,pm6下总共优化了188步,你这个优化到猴年马月去
%chk=scan.chk
%cpu=0-47
# opt=modredundant PM6

Title Card Required

-1 1
C                  6.09873394    4.08523631   -3.41784972
C                  6.33141180    5.33923904   -2.96881592
C                  7.54371867    6.08101792   -3.16178751
C                  5.47589489    5.86931110   -2.09875325
H                  4.52654008    5.29553131   -2.11954591
O                  5.50110681    7.04992772   -1.86569192
N                  8.51510164    6.69282448   -3.30879205
H                  5.11099631    3.69530993   -3.16691180
C                  6.92664715    3.15571057   -4.17749416
C                  6.36333463    1.90590410   -4.48344946
C                  8.23343919    3.43331141   -4.61376184
C                  7.07647748    0.95690251   -5.20250311
H                  5.35306558    1.68399068   -4.14939215
C                  8.94317985    2.48111869   -5.33276826
H                  8.69722069    4.38730056   -4.39472002
C                  8.37076813    1.24460065   -5.62897783
H                  6.62519054   -0.00328342   -5.42966618
H                  9.95141274    2.70622325   -5.66458045
H                  8.93391119    0.50673388   -6.19172360
C                  7.40298823    6.21067123   -1.31160888
C                  7.19563723    4.79815323   -1.82420988
C                  8.33032423    4.37351123   -2.49537288
C                  9.39217223    5.27144823   -2.44737988
C                  8.95523523    6.37934223   -1.46919188
H                  7.22391069    5.34644912   -0.66369507
H                  8.35788823    3.41335523   -3.00252588
C                 10.69553423    5.13421423   -3.05296388
C                 11.74684723    6.06070523   -2.85813888
C                 10.98756923    4.03442923   -3.89879988
C                 12.99094623    5.88978223   -3.45410388
H                 11.58861123    6.93826723   -2.24056888
C                 12.23085423    3.87076323   -4.48546688
H                 10.21239723    3.30091823   -4.09749388
C                 13.25604823    4.79501923   -4.27182988
H                 13.76424823    6.63268423   -3.27339288
H                 12.40305623    3.00761123   -5.12450188
H                 14.22931023    4.66576323   -4.73524388
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