在MS8.0中的DMol3的opt并行效率实测

yjcmwgk

测试环境：

软件：Centos 7和MS 8.0。

硬件：双路主板上有两颗E5-2643v2，关闭超线程。另有64G内存和1T硬盘（肯定够用啦）。

测试体系：

一个三甲醇配位的酞菁钇配合物

计算设置：

# Task parameters

Calculate                     optimize

Opt_energy_convergence        2.0000e-005

Opt_gradient_convergence      4.0000e-003 A

Opt_displacement_convergence  5.0000e-003 A

Opt_iterations                50

Opt_max_displacement          0.3000 A

Initial_hessian               improved

Symmetry                      off

Max_memory                    60000

File_usage                    smart

Scf_density_convergence       1.000000e-005

Scf_charge_mixing             2.000000e-001

Scf_spin_mixing               5.000000e-001

Scf_diis                      6 pulay

Scf_iterations                50

# Electronic parameters

Spin_polarization             unrestricted

Charge                        0

Basis                         dnd

basis_version                 basfile_v4.4

Pseudopotential               vpsr

Functional                    m06l

Aux_density                   octupole

Integration_grid              medium

Occupation                    fermi

Cutoff_Global                 4.8000 angstrom

Cosmo                         ibs

COSMO_Dielectric              32.6300     Methanol

# Print options

Print                         eigval_last_it

测试结果：

首先是一件令人高兴的事儿：每次测试，该计算任务都用了23个step达到opt收敛，不多不少。

五次测试，分别使用了单核心、双核心、四核心、八核心、十二核心。

看结果吧

结论：DMol3的opt并行效率，与Gaussian 09 D 01的opt并行效率，两者对比，前者好得多！

参考：以前我测试过Gaussian 09 D 01的opt并行效率

http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=581

wgbigfatcat

可否给出测试的结构？我刚买了台双路2680v2，想做个对比测试。

qczgzly

哇，DMol3好给力~不知道计算精度跟Gaussian相比如何呢？

ChemiAndy

小卒出品, 有图有真相

yjcmwgk

qczgzly 发表于 2015-6-8 10:51
哇，DMol3好给力~不知道计算精度跟Gaussian相比如何呢？

DMOL3的泛函很少，精度也不够高，但是速度够快

luwis

请问测试关闭超线程的用意是？谢谢 !

anmin0127

yjcmwgk 发表于 2015-6-11 16:54
DMOL3的泛函很少，精度也不够高，但是速度够快

Dmol3的优势好像就是速度快，但是有些计算的精度还是有缺陷

whtu

没做过并行测试，比较好奇怎么做出来的，不知道有没有教程？谢谢。