文件被删除的可能原因

zhou · 发表于 Post on 2015-6-8 10:55:47

本帖最后由 zhou 于 2015-6-8 11:08 编辑

老师好，
之前计算一个分子簇体系，输入文件如下：

然后计算频率时终止了，输出文件结尾部分如下：

我问了超算中心的老师，他们的删除记录里没有删除我的文件，从以前完成计算的输出文件里可以看到错误是出现在下面的地方：

可以由此判断是什么文件出问题了吗？我的*.chk文件还在，还有补救措施吗？
如果重新算，有可能还会遇到这样的问题，太浪费时间了。
谢谢老师们啦！

幻七熏 · 发表于 Post on 2015-6-8 11:02:16

高斯计算过程中的临时文件被删除了，有chk文件可以接着算

zhou · 发表于 Post on 2015-6-8 14:33:29

幻七熏发表于 2015-6-8 11:02
高斯计算过程中的临时文件被删除了，有chk文件可以接着算

哦，谢谢！

buttercup · 发表于 Post on 2015-6-8 17:02:45

幻七熏发表于 2015-6-8 11:02
高斯计算过程中的临时文件被删除了，有chk文件可以接着算

继楼主的问题而请教：
对于因集群断电等作业中途结束后想让作业继续算的问题，我直接拷贝出中途chk文件，并在原输入中使用opt=restart 一直没能好用。在使用restart时有什么需要注意的吗？谢谢各位老师！

幻七熏 · 发表于 Post on 2015-6-8 18:17:13

buttercup 发表于 2015-6-8 17:02
继楼主的问题而请教：
对于因集群断电等作业中途结束后想让作业继续算的问题，我直接拷贝出中途chk文件 ...

可以参看heip里opt关键词

sobereva · 发表于 Post on 2015-6-8 23:46:18

buttercup 发表于 2015-6-8 17:02
继楼主的问题而请教：
对于因集群断电等作业中途结束后想让作业继续算的问题，我直接拷贝出中途chk文件 ...

直接取最后结构继续优化就行了，没必要用restart。

buttercup · 发表于 Post on 2015-6-9 23:31:27

sobereva 发表于 2015-6-8 23:46
直接取最后结构继续优化就行了，没必要用restart。

恩恩，谢谢老师。我用restart没好用，我就这样取结构做了。不过对于irc有时这样做感觉起点就变了，就不是原本要继续的那个点了，会稍有差别

buttercup · 发表于 Post on 2015-6-9 23:32:03

幻七熏发表于 2015-6-8 18:17
可以参看heip里opt关键词

好的，我之后看看，谢谢老师！

sobereva · 发表于 Post on 2015-6-10 00:17:44

buttercup 发表于 2015-6-9 23:31
恩恩，谢谢老师。我用restart没好用，我就这样取结构做了。不过对于irc有时这样做感觉起点就变了，就不是 ...

IRC是应该restart，毕竟整个轨迹都要保留的。几何优化没必要，具体优化的过程无所谓，最终收敛就行了。

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