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[辅助/分析程序] AICD作图分子重合了,该怎样处理?

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发表于 2019-3-14 10:07:08 | 显示全部楼层 |阅读模式
做了苯的正常,做卟吩的,分子重合了,该怎么处理一下?
ben1a_8000_0.050_0_0_1_Aniso_4.4.RenderMich.png
x1a1_8000_0.050_1_0_0_Aniso_4.4.RenderMich.png

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发表于 2019-3-14 11:20:52 | 显示全部楼层
绘制只包含一个视角的图
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 楼主| 发表于 2019-3-14 15:50:32 | 显示全部楼层
本帖最后由 zhww 于 2019-3-14 15:58 编辑

好像也不行,只能截取分子的一部分,不能取整个分子, 好像分子超出了绘图空间。
x1a1_8000_0.050_1_0_0_Aniso_4.2.RenderMich.png

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发表于 2019-3-14 17:21:57 | 显示全部楼层
zhww 发表于 2019-3-14 15:50
好像也不行,只能截取分子的一部分,不能取整个分子, 好像分子超出了绘图空间。

调整视角设置,看
使用AICD程序研究电子离域性和磁感应电流密度
http://sobereva.com/147
如果想在渲染时让视野更大一些,可以将.RenderMich.pov文件开头的location <0, 0, -250>中的-250进行修改,越负视野越大。如果想调节分子朝向,可以在运行AICD时利用-rot选项进行设定,或者直接修改已经生成的.Rotate.inc里面的三个量,和使用-rot是等效的。
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