linux平台下chk转换为fchk出错显示‘’command not found ‘’

cornerj · 发表于 Post on 2019-3-18 14:30:12

请教Sob老师，
初次使用超算平台，l发现chk文件转化为fchk文件竟然出错！
输入：formchk XXX.chk
报错为：-bash: formchk: command not found 是找不到formchk工具么

此博文http://sobereva.com/379 详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
提及 "如果运行formchk时系统提示找不到此可执行文件，9成可能是机子里的Gaussian是菜鸟装的，步骤不合理。
如果你不知道怎么搞，索性直接用绝对路径指明formchk的路径，比如/sob/g09/formchk mizuki.chk。"

但尝试了输入路径/g09/formchk xxx.chk 依旧是报错
没看明白这个路径问题，请问该如何解决？谢谢！

highlight · 发表于 Post on 2019-3-18 14:51:50

还是找不到，说明你的高斯不在那个目录下呗。去问管理员，确认一下高斯放哪了。

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2019-3-18 15:27:03

formchk在哪儿就输入什么路径。先用find命令找到它

cokoy · 发表于 Post on 2019-3-18 15:52:39

你打开你提交作业的脚本看一眼高斯的路径或者设置一下环境变量

cornerj · 发表于 Post on 2019-3-19 21:06:09

谢谢各位的回复！我刚尝试了下，找到绝对路径了，但敲命令回车后
/home-yw/Soft/g09/formchk
直接显示 ‘’ Killed ‘’
这是什么情况，该怎么处理？

yuanyifan · 发表于 Post on 2024-10-17 20:59:49

老师，请问你解决了吗？我遇见了同样的问题

Loading0760 · 发表于 Post on 2024-10-18 09:59:23

yuanyifan 发表于 2024-10-17 20:59
老师，请问你解决了吗？我遇见了同样的问题

你的问题是什么？
-bash: formchk: command not found
还是
‘’ Killed ‘’

如果是前者，就是环境配置的问题。
在命令行直接输入g16，09版本同理，显示command not found吗？如果是那就说明你没加载Gaussian环境。如果不是，
输入which g16，看看路经在哪？一般来说formchk和g16是在同一个目录下，你可以检查一下，目录下有没有。

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