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[VASP] 求助:VASP运行报错请教

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本帖最后由 飞翔的猪 于 2019-5-8 16:50 编辑

大家好,我想请问一下:我是在自己电脑上面运行VASP,系统:Ubuntun16.04,vasp为5.4.4,计算体系:Cu-111-slab,4层,最下面两层固定,做slab结构优化

最近提交任务总是显示:Error reading item 'VCAIMAGES' from file INCAR,想请教是哪个部分出现了问题,谢谢

输入文件如下:
(1)INCAR                                             

system=Cu111                                    
ISTART=0
ICHARG=2
ENCUT=400
EDIFF=1E-4
EDIFFG=-0.01
NSW=200
IBRION=2
ISIF=2
ISMEAR=0
SIGMA=0.1
LWAVE=.FALSE
LCHARG=.FALSE
PREC=High

(2)KPOINTS
Automatic Cu-111
0
Monkhorst-Pack
4 4 1
0 0 0

(3)POSCAR
Cu(111)
1.0
        5.1366000175         0.0000000000         0.0000000000
       -2.5683000088         4.4484261043         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000        21.2910003662
   Cu
   16
Selective Dynamics
Cartesian
    +0.0000000000   +0.0000000000   +0.0000000000    F   F   F
    +2.5683257585   +1.4827939267   +2.0969505409    F   F   F
    -0.0000257524   +2.9656324400   +4.1941142047    T   T   T
    +0.0000000000   +0.0000000000   +6.2910652140    T   T   T
    -1.2841500044   +2.2242131233   +0.0000000000    F   F   F
    +1.2841758748   +3.7070069299   +2.0969505409    F   F   F
    +1.2841243727   +0.7414191966   +4.1941142047    T   T   T
    -1.2841500044   +2.2242131233   +6.2910652140    T   T   T
    +1.2841500044   +2.2242131233   +0.0000000000    F   F   F
    -1.2841243754   +3.7070069299   +2.0969505409    F   F   F
    +3.8524241452   +0.7414191966   +4.1941142047    T   T   T
    +1.2841500044   +2.2242131233   +6.2910652140    T   T   T
    +2.5683000088   +0.0000000000   +0.0000000000    F   F   F
    +0.0000256316   +1.4827939267   +2.0969505409    F   F   F
    +2.5682740201   +2.9656324400   +4.1941142047    T   T   T
    +2.5683000088   +0.0000000000   +6.2910652140    T   T   T

(4)POTCAR: PAW_GGA Cu

运行后会发生报错:
running on    4 total cores
distrk:  each k-point on    4 cores,    1 groups
distr:  one band on    1 cores,    4 groups
using from now: INCAR     
vasp.5.4.4.18Apr17-6-g9f103f2a35 (build Apr 26 2019 19:12:43) complex         
  
POSCAR found type information on POSCAR  Cu
POSCAR found :  1 types and      16 ions
scaLAPACK will be used
LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, standard interpolation
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
Fatal error in PMPI_Alltoallv: Other MPI error, error stack:
PMPI_Alltoallv(665).............: MPI_Alltoallv(sbuf=0xc2b3f00, scnts=0xbe90da0, sdispls=0xbe90d00, MPI_INTEGER, rbuf=0xc2c5b20, rcnts=0xbe90ea0, rdispls=0xbe90e00, MPI_INTEGER, comm=0xc4000003) failed
MPIR_Alltoallv_impl(416)........: fail failed
MPIR_Alltoallv(373).............: fail failed
MPIR_Alltoallv_intra(226).......: fail failed
MPIR_Waitall_impl(221)..........: fail failed
PMPIDI_CH3I_Progress(623).......: fail failed
pkt_RTS_handler(317)............: fail failed
do_cts(662).....................: fail failed
MPID_nem_lmt_dcp_start_recv(302): fail failed
dcp_recv(165)...................: Internal MPI error!  Cannot read from remote process
Two workarounds have been identified for this issue:
1) Enable ptrace for non-root users with:
    echo 0 | sudo tee /proc/sys/kernel/yama/ptrace_scope
2) Or, use:
    I_MPI_SHM_LMT=shm

尝试了输入: echo 0 | sudo tee /proc/sys/kernel/yama/ptrace_scope 显示无效





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发表于 Post on 2019-5-8 10:47:28 | 只看该作者 Only view this author
加个参数:IALGO=48
试试看
另:正经计算441不够

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-8 10:55:14 | 只看该作者 Only view this author
hakuna 发表于 2019-5-8 10:47
加个参数:IALGO=48
试试看
另:正经计算441不够

谢谢你的回复,我加了这个参数,还是会同样报错

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4#
发表于 Post on 2019-5-8 12:03:19 | 只看该作者 Only view this author
google搜了一下你这个报错信息,好像是vasp没找到INCAR文件,你用vim重新写一次INCAR试试。

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发表于 Post on 2019-5-8 12:35:23 | 只看该作者 Only view this author
飞翔的猪 发表于 2019-5-8 10:55
谢谢你的回复,我加了这个参数,还是会同样报错

低版本的VASP算不下去,换了一5.4.4版本的跑了8步就正常结束了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-8 14:59:23 | 只看该作者 Only view this author
灰天皮匠 发表于 2019-5-8 12:03
google搜了一下你这个报错信息,好像是vasp没找到INCAR文件,你用vim重新写一次INCAR试试。

你好  谢谢你的回复,我重新写了INCAR之后可以运行,但是运行了几秒中之后出现了MPIR_Alltoallv_impl(416)........: fail failed
MPIR_Alltoallv(373).............: fail failed
的报错,之前算bulk都正常

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-8 15:00:38 | 只看该作者 Only view this author
hakuna 发表于 2019-5-8 12:35
低版本的VASP算不下去,换了一5.4.4版本的跑了8步就正常结束了

你好,我的vasp是5.4.4,不知道是不是因为我在自己电脑上面算的才会失败了

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发表于 Post on 2019-5-8 18:02:38 | 只看该作者 Only view this author
飞翔的猪 发表于 2019-5-8 15:00
你好,我的vasp是5.4.4,不知道是不是因为我在自己电脑上面算的才会失败了

你串行跑一下看看能不能算下去

像是你的MPI有问题

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-16 15:45:46 | 只看该作者 Only view this author
这个问题已经解决,感谢这个帖子给的解决方法:https://cndaqiang.github.io/2018 ... A%E9%94%99%E8%AF%AF



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发表于 Post on 2023-1-26 08:36:35 | 只看该作者 Only view this author
飞翔的猪 发表于 2019-5-16 15:45
这个问题已经解决,感谢这个帖子给的解决方法:https://cndaqiang.github.io/2018/01/15/intel-mpi-vasp/#% ...

我也遇到了这样的错误,是什么原因啊

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