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[Multiwfn使用咨询] 求助-使用Multiwfn观看分子轨道的问题

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发表于 2019-5-15 21:21:36 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 陈小北 于 2019-5-15 21:22 编辑

sob老师好
我在您的这篇帖子(http://sobereva.com/449)中看到了Multiwfn观看分子轨道的操作流程,我已经操作成功了,只不过我有一个问题是我只想看图中红圈内的轨道部分怎么办,请问怎么把旁边其他部分的的轨道隐藏掉?
就像文献中的这种效果
捕获.PNG 1.PNG

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发表于 2019-5-15 21:31:25 | 显示全部楼层
没有隐藏这一说法,更不能这么做。这些看上去清楚的轨道,不过是把isovalue值适当调大一点。常见的0.02 ~ 0.05都可以使用,在文章计算细节里讲明即可。大于0.05就有点投机取巧的嫌疑了。你画的轨道已经挺清楚了,适当调一下视角会更好。

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发表于 2019-5-15 21:53:22 | 显示全部楼层
仔细看此文第3节,里面说了怎么只显示分子轨道的局部区域
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html

先在Multiwfn界面里手动操作一遍修改波函数信息的步骤,然后自行修改一下showorb.txt文件,把修改波函数信息对应的命令插到此文件开头即可
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 楼主| 发表于 2019-5-16 08:12:34 | 显示全部楼层
zjxitcc 发表于 2019-5-15 21:31
没有隐藏这一说法,更不能这么做。这些看上去清楚的轨道,不过是把isovalue值适当调大一点。常见的0.02 ~ 0 ...

好的,知道了,谢谢您
祝您生活愉快~

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 楼主| 发表于 2019-5-16 08:13:24 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2019-5-15 21:53
仔细看此文第3节,里面说了怎么只显示分子轨道的局部区域
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com ...

好的我去学习,太感谢您了

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发表于 2019-5-16 09:47:35 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2019-5-15 21:53
仔细看此文第3节,里面说了怎么只显示分子轨道的局部区域
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com ...

sob老师,Multiwfn显示轨道局部区域的功能虽然强大、方便、易用,但是万一碰到使用者缺乏理论基础,刻意只显示自己想要的区域,并发表之(没有强调"指定原子贡献"),那会造成歧义或误解的吧?建议您在博文里强调一下“指定原子贡献”和“特殊目的”。

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发表于 2019-5-16 15:09:18 | 显示全部楼层
zjxitcc 发表于 2019-5-16 09:47
sob老师,Multiwfn显示轨道局部区域的功能虽然强大、方便、易用,但是万一碰到使用者缺乏理论基础,刻意 ...

文中第3节开头就有
有时候出于特殊目的,只想显示轨道中指定的原子所贡献的部分而屏蔽其它部分...
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 楼主| 发表于 4 天前 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2019-5-16 15:09
文中第3节开头就有

Sob老师好
我想问一下VMD有没有隐藏H原子的功能
因为感觉图片最后还是有点乱,所以想把H原子隐藏掉看一看
谢谢您

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发表于 3 天前 | 显示全部楼层
陈小北 发表于 2019-5-20 09:18
Sob老师好
我想问一下VMD有没有隐藏H原子的功能
因为感觉图片最后还是有点乱,所以想把H原子隐藏掉看一 ...

graphics - representation里的selected atoms框里输入noh
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