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[辅助/分析程序] 求助chemshell接口QM/MM优化报错

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本帖最后由 jiang012582 于 2019-6-11 15:30 编辑

使用chemshell接口利用QM/MM来优化分子,首先将单晶保存为pdb文件,放到MS里重新按类型排列原子保存为pdb文件,将坐标拷入super.pdb作为输入文件,首先结合高斯在进行resp静电势电荷拟合,应用于amber力场,将得到的1.inpcrd和1.prmtop文件在chemshell力场下进行优化,优化基态S0出现以下报错

请问老师这可能是哪里出错了,是在拟合静电势电荷出错了吗?这是我的文件
我也没有搜到具体解决方法,麻烦有懂的老师帮忙看看,谢谢谢谢

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发表于 Post on 2019-6-10 12:15:49 | 只看该作者 Only view this author
和原子电荷不像有任何直接关系
这种很小众程序基本搜不到有用信息,联系开发者最快
8成是调用量化程序计算QM部分时候存在异常,诸如QM计算用的模型不合理,结果导致提示的HOMO-LUMO gap非常小的警告

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-6-10 14:57:54 | 只看该作者 Only view this author
老师这个是可能是我把单晶放到mercury里面选择packing and slicing堆积构建的模型不合理吗,谢谢老师

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发表于 Post on 2019-6-11 10:29:01 | 只看该作者 Only view this author
jiang012582 发表于 2019-6-10 14:57
老师这个是可能是我把单晶放到mercury里面选择packing and slicing堆积构建的模型不合理吗,谢谢老师

这和个没有必然关系。得肉眼查看结构判断有无异常
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-6-11 15:22:37 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师

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