如何判断两种分子的摆放方式比较稳定？

CayJ · 发表于 Post on 2019-6-12 09:43:30

老师，您好！我想请问一下：我计算的是一个不带有金属元素的有机阳离子与二氧化碳的体系，先设定了几种不同的摆放方式（就是阳离子与二氧化碳的相对位置、相对倾向方向不同，主要是根据哪两个原子之间可能形成氢键进行摆放的，这里的阳离子和二氧化碳都已经结构优化过了。），然后进行结构优化，优化成功后，我可不可以看它们的单点能，不再进行能量计算，就能判断出哪种结构更加稳定？最后再将单点能最小的进行能量计算，计算两个分子之间的相互作用能？这样不是很节省时间吗？或者说结构优化后必须进行能量计算才能判断出哪种结构更加稳定？

sobereva · 发表于 Post on 2019-6-12 19:26:03

优化一般都不会用太高级别，这里提了
浅谈为什么优化和振动分析不需要用大基组
http://sobereva.com/387（http://bbs.keinsci.com/thread-6600-1-1.html）

然而能量的敏感性明显高于结构优化，而分子间相互作用的大小往往又比较弱，如果优化时候用的级别不太高，拿优化直接产生的能量进行能量高低的判断显然不靠谱。除非你在优化时就用了较好级别，但显然这样很不划算。

在此文的计算过程中，充分体现了中低级别优化+高级别算能量的这种常规流程
genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html

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