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楼主 Author: sobereva
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[ORCA] 详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-31 15:22:05 | 只看该作者 Only view this author
qlyfe 发表于 2021-8-31 15:09
老师,用最新版Multiwfn产生的sTD-DFT任务中除了%maxcore一项外,在end前面还多了一个maxcore,请问这里的m ...

这是对TDDFT这个模块专门设置内存使用量的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-8-31 15:29:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-8-31 15:22
这是对TDDFT这个模块专门设置内存使用量的

明白了,谢谢老师

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发表于 Post on 2022-3-10 09:48:42 | 只看该作者 Only view this author
社长,我模仿你的自动生成高斯输入文件的out2gif,改成了自动生成ORCA输入文件的out2inp,但是运行就报错,可以帮忙看看是哪里的错吗?
#!/bin/bash
icc=0
nfile=`ls *.out|wc -l`
for inf in *.out
do
((icc++))
echo Converting ${inf} to ${inf//out/inp} ... \($icc of $nfile\)
Multiwfn ${inf} << EOF > /dev/null
100
2
12
11
${inf//out/inp}
0
q
EOF
done

202203100948237851..png (25.61 KB, 下载次数 Times of downloads: 60)

202203100948237851..png

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发表于 Post on 2022-3-10 10:40:37 | 只看该作者 Only view this author
forpaper 发表于 2022-3-10 09:48
社长,我模仿你的自动生成高斯输入文件的out2gif,改成了自动生成ORCA输入文件的out2inp,但是运行就报错, ...

这个问题解决了。
#!/bin/bash
icc=0
nfile=`ls *.out|wc -l`
for inf in *.out
do
((icc++))
echo Converting ${inf} to ${inf//out/inp} ... \($icc of $nfile\)
Multiwfn ${inf} << EOF > /dev/null
100
2
12
${inf//out/inp}
11
0
q
EOF
done
应该把${inf//out/inp}12和11命令的中间

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发表于 Post on 2022-4-1 13:53:34 | 只看该作者 Only view this author
老师,有在orca说明书里注意到  “The extrapolation method should only be used with verytight SCF. For open shell methods, additional caution is advised”, 是否意味着只有verytight SCF 才能很准确的使用外推法呢


外推.png (120.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 68)

外推.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-1 23:52:19 | 只看该作者 Only view this author
Zhangzhihe 发表于 2022-4-1 13:53
老师,有在orca说明书里注意到  “The extrapolation method should only be used with verytight SCF. For ...

这个verytight是形容必须收敛精度较高,但并不是指关键词必须用verytightscf
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发表于 Post on 2022-4-2 00:20:45 | 只看该作者 Only view this author
Zhangzhihe 发表于 2022-4-1 06:53
老师,有在orca说明书里注意到  “The extrapolation method should only be used with verytight SCF. For ...

这个写法确实有一点歧义,very和tight之间加个空格就好了。我回头改一下
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-26 08:31:46 | 只看该作者 Only view this author
今日更新的Multiwfn的产生ORCA输入文件功能增加了产生revDSD-PBEP86-D4泛函的输入文件的功能,此双杂化泛函在计算有机反应能和弱相互作用方面很好。
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发表于 Post on 2023-12-9 00:33:20 | 只看该作者 Only view this author
请问老师如何利用multiwfn生成orca的S1激发态扫描输入文件呀?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-9 05:35:15 | 只看该作者 Only view this author
jiahui 发表于 2023-12-9 00:33
请问老师如何利用multiwfn生成orca的S1激发态扫描输入文件呀?

Multiwfn目前不支持产生扫描任务的输入文件。自行看ORCA手册
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发表于 Post on 2024-10-5 21:23:37 | 只看该作者 Only view this author
请教:OCRA中的Relaxed Surface Scans是否只能输入内坐标,参考manual做柔性扫描时,把坐标换成笛卡尔坐标,直接报错了。有没有工具可以把xyz转换成ocra能识别的内坐标?
  1. ! r2SCAN-3c opt noautostart nopop
  2. %maxcore     1000
  3. %pal nprocs   4 end
  4. %geom SCAN
  5.         D 2 1 4 6 = 0.0,180.0,36
  6.         end
  7.      end
  8. * xyz   0   1
  9. C     -2.04766429    0.71162750    1.28594942
  10. H     -1.53077554   -0.24423317    1.28594942
  11. H     -3.13386501    0.68071929    1.28594942
  12. C     -1.38439691    1.86076975    1.28594942
  13. H     -1.90128565    2.81663042    1.28594942
  14. H     -0.29819618    1.89167796    1.28594942
  15. *
复制代码


报错 Segmentation fault
out 文件停止在 Evaluating the coordinates …

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-6 01:30:36 | 只看该作者 Only view this author
yaoshi1206 发表于 2024-10-5 21:23
请教:OCRA中的Relaxed Surface Scans是否只能输入内坐标,参考manual做柔性扫描时,把坐标换成笛卡尔坐标 ...

那叫ORCA

此问题和本帖主题无关,应单独发帖,不要借帖子问
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发表于 Post on 2024-10-6 20:23:19 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yaoshi1206 于 2024-10-6 20:25 编辑
sobereva 发表于 2024-10-6 01:30
那叫ORCA

此问题和本帖主题无关,应单独发帖,不要借帖子问

谢谢您的纠正和回复,这个问题我找到解决方式了,测试后用gzmt输入分子坐标,用ORCA做柔性扫描可以正常跑,您上面这个回贴一起给删了吧。

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发表于 Post on 2024-10-23 14:38:16 | 只看该作者 Only view this author
根据2024年10月17日版的更新,请问现在对于DLPNO-CCSD(T)为什么推荐def2-TZVPP基组而不是cc-PVTZ了?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-24 12:25:50 | 只看该作者 Only view this author
孟祥泽 发表于 2024-10-23 14:38
根据2024年10月17日版的更新,请问现在对于DLPNO-CCSD(T)为什么推荐def2-TZVPP基组而不是cc-PVTZ了?

支持的元素多得多,而且直接有/J辅助基组
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