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[GROMACS] 求助关于gromacs中的热浴压浴选择

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楼主
老师您好,我想做聚合物体系在一个大气压下快速降温过程的模拟过程,温度快速降温的模拟从500K到480K,所以我热浴选择的是V-rescale热浴,我想请问随着温度的变化,是否影响盒子内体系压力的震荡?体系中压力是受什么因素影响呢?如果有,我用Berendsen压浴,此时时间常数最好设置多少?降温完成后 我再做10ns的模拟求平均密度,此时的热浴我还用VR热浴,压浴是用PR热浴还是Berendsen都可以呢?谢谢您!
由衷的感谢每一位给与过我帮助的人

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发表于 Post on 2019-6-26 03:05:48 | 只看该作者 Only view this author
变温过程Berendsen压浴,恒定压力过程PR压浴,时间常数一般分别用0.5ps、2ps就可以。

温度显然会影响压力。受什么影响一看压力计算公式就知道,当前盒子体体积、原子坐标、原子间作用力、原子速度都决定压力。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-6-26 08:14:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-6-26 03:05
变温过程Berendsen压浴,恒定压力过程PR压浴,时间常数一般分别用0.5ps、2ps就可以。

温度显然会影响压 ...

非常感谢您的回复!!!
由衷的感谢每一位给与过我帮助的人

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