（已）求助：gmx5.1.2版本的mdp文件更改…

路过的一只 · 发表于 Post on 2019-7-4 21:33:28

本帖最后由路过的一只于 2019-7-6 13:31 编辑

这是我的minimization.mdp文件，仿照着martini官网的例子改的之前用的gmx4.6.5版本的mdp文件。

GUDUGUDU · 发表于 Post on 2021-7-16 10:28:18

你好，请问可以发一下你的GROMACS5版本的nvt,npt和md的mdp文件吗？我自己改的mdp文件，但一直报错
2 particles communicated to PME rank 6 are more than 2/3 times the cut-off out of the domain decomposition cell of their charge group in dimension y.
This usually means that your system is not well equilibrated.
有也不知道怎么回事

芮啦 · 发表于 Post on 2022-6-11 22:37:32

GUDUGUDU 发表于 2021-7-16 10:28
你好，请问可以发一下你的GROMACS5版本的nvt,npt和md的mdp文件吗？我自己改的mdp文件，但一直报错
2 parti ...

请问您的问题得到解决了吗，我现在也遇到了相同的问题，能否请您指点一下

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[GROMACS] （已）求助：gmx5.1.2版本的mdp文件更改…

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