求助，刚性扫描

幸运兔 · 发表于 Post on 2015-7-1 11:21:34

老师你好，我想看看两个邻二氮杂菲分别于中间的咔唑所构成的两个二面角进行变化，其他结构信息不进行更改，看看，随着这两个二面角进行更动，相应的跃迁能以及振子强度如何变化。下面是我的分子结构：

我设定了D12以及D42进行每30度扫描一次，发现扫描到53步时两个N原子挨的很近，

我发现D42以及D41规定了同一个二面角，

如果只设定D42每30度扫描一下，对D41不进行设定，这样的话会导致两个N原子挨到一起，我如果把D41后面对应的角度去掉或者直接去掉D41，进行D42每30度扫描都会出错，真不知道该怎么办，求指教

其中D12为 C15，C14，C13，C7构成的，D42为N44 C23 C24 C26构成的，D41为N45 C23 C24 C26构成的。

sobereva · 发表于 Post on 2015-7-1 15:51:24

刚性扫描时，如果你只指定扫描一个二面角，那么扫描过程中只有这一个二面角会动，其它几何变量不会动，所以你会看到片段没有整体动，动的只是一个或几个原子，它一动结果把环给破坏了。

对当前目的，适合用柔性扫描，这样相应的片段整体会一起动。如果非要刚性扫描，为实现目的需要调整内坐标写法，但比较麻烦，最好是在gview里让二面角每旋转一点就保存一个单点输入文件，然后批量执行、批量提取能量。

毕竟激发态计算比较耗时且体系不小，为了避免白浪费时间，在搞熟悉扫描的用法之前，建议先用廉价的半经验方法练习。扫描过程确认没问题了再换成TDDFT。

幸运兔 · 发表于 Post on 2015-7-1 16:45:49

sobereva 发表于 2015-7-1 15:51
刚性扫描时，如果你只指定扫描一个二面角，那么扫描过程中只有这一个二面角会动，其它几何变量不会动，所以 ...

谢谢老师谢谢

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